NCBI下载SRA数据
从NCBI下载数据本来是一件很简单的事情，但是今天碰到几个坑： 1、paper里没有提供SRA数据号、也没有提供路径； 2、不知道文件在ftp的地址，不能直接用wget下载 所以通过在NCBI官网，直接在SRA搜索栏里： 输入paper的title关键词NIFTY BGI ...
原文：使用sratoolkit下载NCBI数据
如何使用sratoolkit下载NCBI数据 比如我想下载这个研究的数据， 使用prefetch命令，输入对应的SRA号码 prefetch SRR 默认下载限制是 G的数据，如果下载的数据较大，可以修改配置，比如改为最大 G prefetch max size G SRR 如何修改默认配置，特别是下载数据的存放位置 vdb config i 进入这个界面，需要按照指示操控键盘进行修改 如果上面这 ...
2020-04-09 13:56 0 1420 推荐指数：
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主要参考这篇文章： http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzA5NjU5NjQ4MA==&mid=2651154488&idx=1&sn=e693 ...
NCBI SRA数据库使用详解
/48272598_749456477.shtml 我的下载的数据在/home/username/ncbi/public/s ...
7、sraToolkit安装使用
参考：http://blog.csdn.net/Cs_mary/article/details/78378552 ###prefetch 参数解释 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK158900 ...