文章转载于 Original 2017-07-11 liuhui 生信百科 多序列比对（或多序列联配，multiple sequence alignment，MSA），是指把多条（3 条或以上）有系统进化关系的蛋白质或核酸序列进行比对，尽可能地把相同的碱基或氨基酸残基排在同一 ...

Aligning Sequences In this tutorial, we will show how to create a multiple sequence alignm ...

用blastall进行序列比对 blastall是最常用的blast程序之一，其功能非常强大，其下面有非常多的参数，但是一般使用的参数如：-p、-i、-d、-o、-e等几个。 -p: 执行的程序名称 -d: 搜索的数据库名称 -i : 要查询的序列文件名(Query File ...

目录 目标物种和序列 相关Seq列表 多序列比对的原理和方法 相关的工具 建树的几种方法 实际操作 Muscle&ClustalW 可视化 ...

2021年了，从零开始几个字可以去掉了，做了很多次服务器搭建，其实能够叫零的之前已经是讲完了。 其实应该做一个总结，但是没有时间，后面再说吧。 本文也没有什么内容，因为很简单： 首先， conda install orthofinder # 安装muscle iqtree ...

序列比对那点事儿 2012-04-17 ~ ADMIN 本来这应该是一本书，那样的话的确需要花一点心思，就写成一篇短文吧。 从字符比对开始说起吧。第一个问题最简单，如何判断两个字符串是相等的。 int strcmp(const ...

简介 最经典和广为熟知的多序列比对软件是 clustalw 。 但是现有的多序列比对软件较多，有文献报道：比对速度（Muscle>MAFFT>ClustalW>T-Coffee），比对准确性（MAFFT>Muscle>T-Coffee> ...

1.软件的安装： 网站：http://www.megasoftware.net/ windows上安装，下载windows-command line（cc）版本的，格式为zip，解压之后，里面有两 ...