原文:多组学分析及可视化R包

最近打算开始写一个多组学 包括宏基因组 S 转录组 蛋白组 代谢组 关联分析的R包,避免重复造轮子,在开始之前随便在网上调研了下目前已有的R包工具,部分罗列如下: . mixOmics 应该是在多组学领域知名度最高的一个R包,有专门的团队,做了十余年了,引用量也比较高。 官网:http: mixomics.org 文章:mixOmics: An R package for omics featur ...

2020-03-30 13:01 0 4263 推荐指数:

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可视化学分析软件:MATLAB R2021a for Mac

未来软件园为大家带来了MathWorks系列的全新版本,MathWorks MATLAB R2021a简称为MATLAB R2021a,是一款可视化的专业数学分析软件,这款软件拥有分析数据、开发算法、创建模型,数据图表,APP打包、APP开发等一系列功能。大家无论是分析数据、开发算法还是创建 ...

Wed Jun 23 18:57:00 CST 2021 0 180
MetaboAnalyst的多组学分析

MetaboAnalyst是做代谢的R,功能十分强大。也开发了web版本,代谢组学的分析这里不介绍,主要讲讲它开发的多组学分析的相关内容。 既然是做代谢的工具,即使是增加了多组学内容,肯定也是以代谢为核心。以代谢组为中心的多组学分析想想无非就是以下几点:多元变量统计分析、网络分析 ...

Fri Nov 22 17:56:00 CST 2019 0 2491
R语言的可视化

)、无序(不可比较) 1. 数值变量特征和可视化 集中趋势测量(均值、中位数、众数) 均值=(数 ...

Mon Jul 17 19:17:00 CST 2017 1 2244
可视化数据分析工具-CapAnalysis

可视化数据分析工具-CapAnalysis 我们知道,Xplico是一个从pcap文件中解析出IP流量数据的工具,本文介绍又一款实用工具—CapAnalysis(可视化数据分析工具),将比Xplico更加细致的分析功能,先别着急安装,下面我们首先了解Pcap的基本结构,然后告诉你如何使用 ...

Tue May 20 03:24:00 CST 2014 0 4064
R语言——limma进行多组差异表达分析

目录 1. 加载表达矩阵 2. 创建样本分类表 3. 加载limma,构建如下矩阵 4. 规定哪一组数据与哪一组数据比较 5. 获取差异表达数据 6. 导出差异表达数据 1. 加载表达矩阵 2. 创建样本分类表 获得类似 ...

Sun Mar 07 07:50:00 CST 2021 0 1681
R语言代写生存分析数据分析可视化案例

目标 本文的目的是对如何在R中进行生存分析进行简短而全面的评估。关于该主题的文献很广泛,仅涉及有限数量的(常见)问题/特征。可用的R数量反映了对该主题的研究范围。 R 可以使用各种R来解决特定问题,并且还有替代功能来解决常见问题。以下是本次 ...

Tue Jun 25 01:00:00 CST 2019 0 521
汽车数据的可视化分析R

数据下载:http://www.fueleconomy.gov/feg/epadata/vehicles.csv.zip 将数据导入R中, 1.首先将工作路径设定到本地保存了vehicles.csv的路径下: 2.我们可以直接从zip文件中载入数据,只要你知道zip中压缩 ...

Sun Feb 11 07:03:00 CST 2018 0 1076
R语言可视化之箱图

lattice中的箱图 bwplot(Species~Petal.Length,data=iris) 拓展:分位箱图 library(Hmisc) bwplot(Species~Petal.Length,data=iris,panel=panel.bpplot ...

Fri Nov 24 05:40:00 CST 2017 0 1110
 
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