第一步：申请密钥 https://plot.ly/#/ 注册一个账号，第一次需要生成密钥 第二步： 运行结果： 这个图的看法：从右往左依次画竖线分成多个部分 ...

1、脚本 2、聚类过程的示意树状图 3、按语 此树状图的底部显示的是数据点，这些数据点作为叶节点最终形成一棵聚类树，每合并两个两个簇就生成一个父节点。 ...

邻接列表及其类似结构 　　对于图结构的实现来说，最直观的方式之一就是使用邻接列表。下面我们来实现一个最简单的：假设现在我们有n个节点，编号分别为0，...，n-1。 　　然后，每个邻接列表就是一个数字列表，我们可以将他们编入一个大小为n的主列表，并用节点编号对其进行索引。 　　 　　邻接集 ...

聚类：计算distance：dist(data),data必须是数字类型的，如果有字符串类型的必须去掉。否则会出现错误。 热图： 两种方法：一是ggplot2自带的geom_tile()；二是pheatmap包。 一，使用geom_tile()，需要自己聚类数据。 二，使用 ...

　　聚类广泛用于数据分析。去年研究了一下R语言聚类树的绘图原理。以芯片分析为例，我们来给一些样品做聚类分析。聚类的方法有很多种，我们选择Pearson距离、ward方法。 选择的样品有： R语言代码实现Pearson聚类： R语言作图 ...

1. kmeans算法简介 待补充 2. python实现 2.1 基础版 kmeans算法，前几天的一道面试在线编程题目。好久不用python手法都生疏了，写的很慢。不过后来对比了下网络上的其他kmeans的python实现，感觉自己的实现相对简洁美观，代码量少。这主要依赖于numpy包 ...

什么是谱聚类？ 就是找到一个合适的切割点将图进行切割，核心思想就是： 使得切割的边的权重和最小，对于无向图而言就是切割的边数最少，如上所示。但是，切割的时候可能会存在局部最优，有以下两种方法： （1）RatioCut：核心是要求划分出来的子图的节点数尽可能的大 分母变为子图 ...

三体下载 将下载的文件重命名为santi.txt,放在文件的目录下 ...