MatrixEQTL是一个快速有效的cis/trans eQTL mapping分析工具,被The Genotype-Tissue Expression (GTEx)数据库用于eQTL mapping分析。使用MatrixEQTL进行eQTL mapping需要五个输入文件,即SNP.txt ...
GTEx database:该数据库是健康人贡献的组织的RNASeq的数据。还有snp信息。将snp信息与gene的表达水平结合起来。 donor: donor贡献的tissue。 gene表达水平 用FPKM表示gene的表达水平 受其周围snp的影响,这样的gene叫做egene。这样的snp叫做eQTL。即:snp会影响gene的表达。 按照正常情况,可以得出结论:不同人的相同组织的gene ...
2020-03-15 20:51 0 3918 推荐指数:
MatrixEQTL是一个快速有效的cis/trans eQTL mapping分析工具,被The Genotype-Tissue Expression (GTEx)数据库用于eQTL mapping分析。使用MatrixEQTL进行eQTL mapping需要五个输入文件,即SNP.txt ...
转自生信菜鸟团,如有侵权j,请联系微信:biozhangz进行删除. GTEx数据库-TCGA数据挖掘的好帮手 Posted on 2018年11月26日 通常我们在挖掘TCGA数据库的时候,会发现该项目纳入的正常组织测序结果是非常少的,也就是说很多病人都不会有他的正常 ...
及整理 从GTEX官网下载表达谱数据并与表型文件整理合SummarizedExperiment格式 ...
sql编程 为什么要使用sql编程? 标准的sql是非过程化的查询语言 特点:操作简单、面向集合、功能丰富、使用简单等 缺点:缺少流程控制能力,难以实现应用业务中的逻辑控制 办法:使用sql编程,可以提高应用系统和数据库管理系统间的互操作性 使用sql编程来访问和管理 ...
什么是数据库,为什么要学习数据库 JavaEE:企业级Java开发 Web 前端:(页面:展示 数据) 后台:(连接点:连接数据库JDBC,连接前端(控制,控制视图跳转,给前端传递数据)) 数据库:(存数据:Txt,Excel,Word) 为什么要学习数据库 1.岗位要求 ...
数据库巡检的内容通常涵盖主机硬件、操作系统和MySQL巡检项。其中,主机/os巡检主要包括:主机的硬件配置、CPU/内存/磁盘使用率以及磁盘的I/O使用情况;MySQL巡检项包括:数据库配置、用户权限、大表数据量、业务表主键和自增长情况、数据库的并发性、当前和历史连接情况统计、备份执行情况 ...
时空数据库管理移动对象,比如:汽车、飞机、地貌变化等。空间数据库是时空数据库的特例,即时刻固定。 轨迹压缩 每秒钟都会从 GPS 获取大量 $(x,y,t)$ 格式的数据,如何在不降低物体轨迹精度的前提下减小数据量呢?主要有三个指标:处理时间、压缩率、误差测量。 误差:原始轨迹位置 ...
看到mysql数据库上传信息的代码中有commit操作,但是不知道commit是干什么用的,在网上查了一下并做了记录(如下): commit提交事务,数据库在进行插入(insert)操作时需不需要commit 取决于数据库的存储引擎是否支持事务处理。(关于)事务处理请看 如果是不支持 ...