R语言——limma包进行多组差异表达分析
目录 1. 加载表达矩阵 2. 创建样本分类表 3. 加载limma包，构建如下矩阵 4. 规定哪一组数据与哪一组数据比较 5. 获取差异表达数据 6. 导出差异表达数据 1. 加载表达矩阵 2. 创建样本分类表 获得类似 ...
原文：用“limma”进行差异表达分析
.概述 矩阵 函数 表达矩阵 lmFit 分组矩阵 eBayes 差异比较矩阵 topTable .读取表达矩阵： 得到表达矩阵exprSet，它的列是各个样本名称，行是各个探针ID，一个纯粹的表达矩阵，必须是数字型的 可以简单地做一下该表达矩阵的QC检测： 如果这些boxplot发现各个芯片直接数据还算整齐，则可以进行差异比较。 .制作分组矩阵 design就是分组矩阵，需要根据我们下载的芯片 ...
2020-03-09 14:45 0 697 推荐指数：
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