原文:使用Juicer组装HiC

Juicer相比其他软件还是蛮有优势的。文章中介绍突出的两个优点是 流程化,使用简单。 高性能,平行计算,对大数据友好。 Under home user juicedir, there should be a folder references that contains the reference fasta file for your genome and the BWA index fil ...

2020-03-03 20:54 0 901 推荐指数:

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HiC

Hi-C是高通量染色体构象捕获(High-throughput Chromosome Conformation Capture, Hi-C)技术的简称,开发于2009年,最初用于捕获全基 ...

Fri Dec 20 01:27:00 CST 2019 0 1154
【基因组组装HiC挂载软件以及如何用Juice_box手工纠错?

目录 1.常用HiC挂载软件 2. Juice_box手工纠错 1.常用HiC挂载软件 ALLHiC 张兴坦老师专为多倍体和高杂合度物种基因组挂载开发。如果是复杂基因组,肯定是首选。对于简单基因组,我跑了下,结果不佳。提了issue,张老师特意开发 ...

Mon Mar 29 07:18:00 CST 2021 0 1036
Juicer模板引擎使用笔记

关于Juicer:Juicer 是一个高效、轻量的前端 (Javascript) 模板引擎,使用 Juicer 可以是你的代码实现数据和视图模型的分离(MVC)。 除此之外,它还可以在 Node.js 环境中运行。Juicer中文文档地址:http://juicer.name/docs ...

Tue Sep 27 07:01:00 CST 2016 0 2232
使用 CompletableFuture 异步组装数据

使用 CompletableFuture 异步组装数据 一种快捷、优雅的异步组装数据方式 实际项目中经常遇到这种情况: 从多个表中查找到数据然后拼装成一个VO返回给前端。 这个过程有可能会非常耗时。因为最终每一条返回的VO数据是由多个表中的数据拼装而成,如果项目还是微服务需要从其他服务获取数据 ...

Sun Feb 02 07:41:00 CST 2020 0 1081
SOAPdenovo组装软件使用记录

背景: 1、为什么要从头测序组装基因组? 基因组是不同表型的遗传基础;获得参考基因组是深入研究一个生物体全基因组的第一步也是必须的一步;从头测序组装能够对新的测序物种构建参考基因组; 2、为什么要研究全基因组? 确定基因组中缺失了什么;确定难以生化研究的基因和pathways ...

Sat May 27 21:57:00 CST 2017 0 5333
jstree -- 使用JSON 数据组装成树

概述: 前面主要是html数据,这里主要是json数组 1.格式 jsTree需要一个具体格式JSON数据,在标准的语法没有那个字段是必须的-而是那些是你需要的。请记住你可以获取任何你请求的其他属性,jsTree将会不会碰他们,你将有可能在随后使用它们。 为了改变节点的图标你可以是用属性 ...

Tue Aug 29 21:55:00 CST 2017 0 2853
 
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