原文:FDR及Benjamini-Hochberg方法

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2020-02-28 18:54 0 961 推荐指数:

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FDR校正

一、假设检验 假设检验的基本思路是: 设立零假设(null hypothesis)H0,以及与零假设H0相对应的非零假设(alternative hypothesis)H1,在假设H0成立的前提下 ...

Mon Aug 03 05:06:00 CST 2020 0 699
matlab FDR校正

http://home.52brain.com/forum.php?mod=viewthread&tid=27066&page=1#pid170857 http://www.math ...

Sat Nov 28 17:46:00 CST 2015 0 4747
SPM FDR校正

来源: http://blog.sciencenet.cn/blog-479412-572049.html,http://52brain.com/thread-15512-1-1.html SPM8允许两种FDR校验。一个是voxel-wise FDR,另一个是topological ...

Wed Oct 28 23:41:00 CST 2015 0 3154
差异表达分析之FDR

差异表达分析之FDR 随着测序成本的不断降低,转录组测序分析已逐渐成为一种很常用的分析手段。但对于转录组分析当中的一些概念,很多人还不是很清楚。今天,小编就来谈谈在转录组分析中,经常会遇到的一个概念FDR,那什么是FDR?为什么要用FDR呢?一起来学习吧! 什么是FDR ...

Wed Nov 07 06:42:00 CST 2018 0 1757
p值还是 FDR ?

p值还是 FDR ? 差异分析 如何筛选显著性差异基因,p value, FDR 如何选 经常有同学询问如何筛选差异的基因(蛋白)。已经计算了表达量和p value值,差异的基因(蛋白)太多了,如何筛选。其中最为关键的是需要对p value进行校正 ...

Sat Nov 10 05:40:00 CST 2018 0 1386
浅谈多重检验校正FDR

浅谈多重检验校正FDR Posted: 四月 12, 2017 Under: Basic By Kai no Comments 例如,在我们对鉴定到的差异蛋白做GO功能注释后,通常会计算一个p值。当某个蛋白的p值小于0.05(5%)时,我们通常认为这个蛋白在两个样本中的表达 ...

Sat Nov 10 05:37:00 CST 2018 0 2238
Multiple Testing | 多重假设检验 | FDR

RNA-seq数据分析中,为了鉴定两个group 差异表达的基因,会针对每一个基因分别做假设检验(例如T-test),这里会出来一个P-value,但是往往R中专门做差异表达的package,还会有Adjusted-P 这么一个P-value。或者我们经常会碰到FDR这个概念。这些说的都是 ...

Sun Jul 26 01:59:00 CST 2020 0 1453
 
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