在进化过程中，新基因通常来自事先存在的基因，新基因的功能从先前基因的功能进化而来。新基因的原材料 来自基因组区域的重复，这种重复可包括一个或多个基因。 　　作为物种形成的伴随事件而被重复，并继续保持相同功能的基因，称为直系同源基因（orthologous gene）。 新的基因功能可由 ...

gene ontology为了查找某个研究领域的相关信息，生物学家往往要花费大量的时间，更糟糕的是，不同的生物学数据库可能会使用不同的术语，好比是一些方言一样，这让信息查找更加麻烦，尤其是使得机器查找无章可循。Gene Ontology就是为了解决这种问题而发起的一个项目。 Gene ...

本文为入门级的基因调控网络文章，主要介绍一些基本概念及常见的GRN模型。 概念：基因调控网络 (Gene Regulatory Network, GRN)，简称调控网络，指细胞内或一个基因组内基因和基因之间的相互作用关系形成的网络，特指基因调控 (gene regulation) 导致基因 ...

GWAS研究中经常涉及到基因座（locus）的概念，下面简要介绍一下批量注释基因到基因座的方法。 1、单个基因注释到基因座 对于单个基因的基因座注释，比较简单，常用的工具有：UCSC Genome Browser、NCBI。 比如UCSC Genome Browser： 还有NCBI ...

本文转载自 基因结构 - 知乎 (zhihu.com) 我们都知道不论真核与原核生物都离不开基因，它储存着生长、发育、凋亡等几乎全部生命过程的信息。那么基因有着哪些结构呢，接下来从三个层面来讨论基因的构成： 一、DNA 编码区 Coding region 基因在结构 ...

　 　 　　 　　认为来自不同物种的一组基因的进化关系（基因树，gene tree）与这些物种本身的进化关系（物种树，species tree） 一定相同，似乎是合理的，因为这些基因存在于这些物种的基因组中。但情况并非如此。基因树不一定与物种树相同。 　　基因树可以和物种 ...

全基因组关联分析除了找到显著的关联位点，我们还可以做基因优化、geneset富集分析、组织富集分析，下面具体讲一讲怎么利用GWAS的summary数据做这个分析。 summary数据就是关联分析的结果文件 1 软件安装前请确保需要满足的系统环境 1.1 支持Mac OS X ...

数据库，选定类别，基因名字类型，输出的就是整个数据库。 但是想调用这个函数没那么简单，得导入一系 ...