ggplot2绘图系统——几何对象之散点图 以geom开头的函数超过30个。几何对象和标度函数scale密不可分。只有在aes中传入某个变量，scale才能发挥作用。 所谓标度scale，就是图形遥控器，用于控制元素属性。相对于color/shape等参数而言，可以进行更多、更精确的设置 ...

ggplot2绘图系统——heatmap、geom_rect 这里不介绍更常见的pheatmap包。 1.heatmap函数 基础包。 2.geom_tile ggplot2 中，热图可看作若干个小矩形组成。其几何对象就是rect（矩形）或tile（瓦片），两者效果相同。 ...

ggplot2绘图系统——几何对象之直方图、密度图 1.直方图 参数。 示例。 2.概率密度曲线 三种方法： ...

ggplot2绘图系统——添加标签与文本、数学表达式、条形图文本、注释 1. 文本与标签添加 geom_label的文本将以标签形式出现，即文本会带有一个背景色。 geom_text则是纯文本形式展示。 annotaete函数则在图上添加一个注释图层。 文本 ...

ggplot2绘图系统——图例：guide函数、标度函数、overrides.aes参数 图例调整函数guide_legend也属于标度函数，但不能单独作为对象使用，即不能如p+guide_legend()使用。 1. guides及guides_legend函数 guide_legend ...

ggplot2绘图系统——标题 在期刊杂志中，需要设置的图形标题并不多。 除了图形标题，还有坐标轴标题（标签)、图例标题、脚注等。 标题函数：ggtitle,labs 坐标轴标题函数：xlab,ylab labs的参数可以是title,subtitle,caption,x,y ...

ggplot2绘图系统——图形组合、字体选择、保存输出 1.图形组合 一页多图在基础包中利用par和layout函数来切分画布。 ggplot2是先铺好网格背景，再进行绘图，所以要通过切分网格背景来实现一页多图。 gridExtra包（grid扩展包）可用于图形排列组合、表格对象排列组合 ...

ggplot2绘图系统——统计变换函数 在几何对象中以参数stat形式出现。 不同的几何对象对应不同的统计变换函数。 以直方图为例，几何对象geom_histogram(..., stat='bin')与stat_bin(.., stat='bar')的作用是一样的。 一般而言，我们不需要 ...