根据拿到的表达矩阵设为exprSet 用scale 进行标准化 数据中心化：数据集中的各个数字减去数据集的均值 数据标准化：中心化之后的数据在除以数据集的标准差。 在R中利用scale方法来对数据进行中心化和标准化 并不是表达矩阵里面的所有基因都可以进行相关性分析，首先去除reads count gt 小于 个的基因 测试样品共有 个 另一种标准化 hclust 聚类分析 欧式距离 Euclide ...
2020-02-05 20:58 0 2174 推荐指数：
无生物学重复RNA-seq分析 CORNAS: coverage-dependent RNA-Seq analysis of gene expression data without biological replicates BMC Bioinformatics 的一篇文章中提出了一种新 ...
尹师妹：“哈师兄，做验证实验好辛苦，老板让我提高筛选差异基因的条件，尽量降低假阳性，我该怎么筛？” 小哈打开Evernote，给尹师妹看张表： “瞧见那个100%了吗？30 million mapped reads的情况下，10次重复，2倍筛选条件，Statistical ...
来源https://baike.baidu.com/item/%E6%A3%80%E7%B4%A2%E8%A1%A8 定距式 这种形式也叫退格式检索表。在编排时每两个相对应的分支的开头，都编在离左端同 ...
什么是RNA-Seq (RNA Sequencing) 2011-07-14 ~ ADMIN 随着ome为词尾的各种组学的出现，转录组学已经成为了人们了解生物信息的一个重要组成部分。人们使用了许多办法来掌握转录组的情况，主要分为两类，一类是基于杂交，一类是基于下一代测序技术 ...
简单理解RNA-seq 刘小泽 已关注 2018.10.17 23:51* 字数 1518 阅读 46评论 0喜欢 3 今天就当一个小故事看吧，看了statQuest，感觉讲的很棒，于是分享给大家原版视频后台回复 ...
转录组测序中生物学重复如何来设 1.区分生物学重复与技术重复 生物学重复：指样本重复，比如3只小鼠，同时做一种处理，就是三个生物学重复。 技术重复：一般是三次实验，比如对一块组织，提了三次RNA，做三次real time。 2.设置生物学 ...
冷冻电镜 为什么冷冻电镜 (Cryo-EM) 技术的发明可以获得2017诺贝尔化学奖？知乎看法 Press release: The Nobel Prize in Chemistry 2017 ...
这部分开始进行基本的富集分析，两类 A：差异基因富集分析（不需要表达值，只需要gene name） B: 基因集(gene set)富集分析（不管有无差异， ...
