原文:使用metaCCA进行单/多个SNP与多表型的典型相关性分析

欢迎来到 bio生物信息 的世界 新年的第一篇更文。 祝大家新春快乐 身体健康 号回家以后,经历了如下过程。 号 喉咙痛 号 喉咙痛 号喉咙痛 咳嗽 号 咳嗽 号 咳嗽为主 鼻塞 夜间咳嗽加剧 号 咳嗽为主 鼻塞 流鼻涕 夜间咳嗽加剧 号 咳嗽为主 鼻塞 流鼻涕 打喷嚏 夜间咳嗽加剧 号 咳嗽为主 鼻塞 流鼻涕 打喷嚏 夜间咳嗽加剧 换了多种药物,均不见效。 索性也少关注新型病毒肺炎的事了,缓解些 ...

2020-01-28 16:07 7 1454 推荐指数:

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一次计算多个表型的遗传相关性(LDSC, GCTA)

遗传相关的计算之前介绍过几次了,感兴趣的翻之前的推文: 1、利用GCTA工具计算复杂性状/特征(Complex Trait)的遗传相关性(genetic correlation) 2、LD SCore计算基因多效、遗传度、遗传相关性 之前的两篇推文均有一个小局限,就是针对多个表型间的遗传 ...

Sat Oct 24 04:11:00 CST 2020 0 1091
使用R进行相关性分析

基于R进行相关性分析 一、相关性矩阵计算: [1] 加载数据:   >data = read.csv("231-6057_2016-04-05-ZX_WD_2.csv",header=FALSE) 说明:csv格式的数据,header=FALSE 表示没有标题,即数据从第一 ...

Sat Sep 10 00:25:00 CST 2016 6 42396
相关性分析

相关性分析 相关性分析解决解决以下两个问题: 判断两个或多个变量之间的统计学关联; 如果存在关联,进一步分析关联强度和方向 双变量相关系数 Pearson相关系数 用于度量两个变量X和Y之间的相关程度(线性相关),其值介于-1与1之间,定义为两个变量的协方差除以他们的标准差 ...

Wed Feb 10 21:39:00 CST 2021 0 874
相关性分析

corr 线性或等级相关 折叠全部页面 句法 rho = corr(X) rho = corr(X,Y) [rho,pval] = corr(X,Y ...

Wed Apr 15 21:43:00 CST 2020 0 862
相关性分析

什么是相关性分析相关性分析研究现象之间是否存在某种依存关系,对具体有依存关系的现象探讨相关方向及相关程度。 相关分析是一种简单易行的测量定量数据之间的关系情况的分析方法。可以分析包括变量间的关系情况以及关系强弱程度等 有点类似于特征提取 常用的相关性分析方法 协方差及协方差矩阵 ...

Fri Oct 09 22:08:00 CST 2020 0 810
相关性分析 散点图

import pandas as pddf2=pd.read_excel('./data/data2.xlsx',index_col='产品编码')df2.head()x=df2['供应商进货价']y ...

Fri Oct 04 04:03:00 CST 2019 0 887
pandas相关性分析

DataFrame.corr(method='pearson', min_periods=1) 参数说明: method:可选值为{‘pearson’, ‘kendall’, ‘spearman’} pearson:Pearson相关系数来衡量两个数据集合是否 ...

Tue Apr 21 18:46:00 CST 2020 0 4310
matlab 相关性分析

Pearson相关系数 考察两个事物(在数据里我们称之为变量)之间的相关程度,简单来说就是衡量两个数据集合是否在一条线上面。其计算公式为: 或或 N表示变量取值的个数。 相关系数r的值介于–1与+1之间,即–1≤r≤+1。其性质如下: 当r>0时,表示两变量 ...

Fri Jan 01 18:21:00 CST 2016 0 8671
 
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