原文:蛋白组学生物信息资源列表

前言 在工业界,天天做着重复的简单工作,已失去了对领域新技术发展的敏感性和好奇心,对技术人员来说这是件可怕的事情。因为没时间,也没兴趣看文献,不能掌握第一手资料,只能在网上找找已有的信息,随便翻翻大佬的博客,看看人家在做什么。这样也能稍稍了解行业动态,有助于对知识的思考和业务水平的提升。 工具包 Bioconductor workflow: 关于蛋白组的内容并不多,目前只有proteomics这一 ...

2020-01-13 23:31 0 1199 推荐指数:

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蛋白组学之外泌体

1. 外泌体研究背景: 胞外囊泡是从细胞膜上脱落或者由细胞分泌的具有双层膜结构的囊泡状小体,主要由微囊泡、凋亡小体、外泌体组成。而外泌体是其中一类小囊泡,直径为30~150nm,密度1.10~1.18 g/ml,可携带核酸、蛋白质质和脂质等,存在于血液、唾液、尿液等多种体液中 ...

Thu Mar 26 19:09:00 CST 2020 0 999
蛋白组学定量值得比较说明

1. Maxquant的iBAQ和LFQ,该用哪个?我们使用Maxquant做Label Free蛋白学定量分析的时候,在Maxquant的参数设置时,会遇到两个参数,LFQ和iBAQ,那么,选择哪个好呢?如果你都选上,在最终的proteingroups.txt中,会出现三列 ...

Mon Oct 21 21:04:00 CST 2019 0 1368
蛋白组DIA分析:Spectronaut软件使用指南

官方文档: https://biognosys.com/media.ashx/spectronautmanual.pdf 0. 准备 Spectronaut软件是蛋白组DIA分析最常用的谱图解析软件之一,优点是定量准确,缺点是高额收费,window版本,速度慢。一起来简单了解下用法 ...

Fri Mar 13 00:11:00 CST 2020 0 2064
信息资源管理---已过笔记

一、信息资源管理相关概念 1. 信息是事物运动的状态以及它的状态改变的方式。它既不是物质,也不是能量,而是一个与物质和能量既有联系又有区别的新概念。分为本体论和认识论信息。有为主体消除或减少某种不确定性。 2. 信息的分类: (1)信息的产生和作用机制划分:自然信息和社会信息。(2)感知 ...

Tue Aug 31 22:08:00 CST 2021 0 398
学生信——生物基本概念

1、ORF:开放阅读框,开放阅读框是基因序列的一部分,包含一段可以编码蛋白的碱基序列,不能被终止子打断。从起始密码子开始,到终止密码子结束。前面是5‘UTR, 后面是3’UTR,ORF一般是针对mRNA来说的。 mRNA由基因序列转录得来,一个基因可能有几条不同的转录本,因而对 ...

Tue Jun 01 19:12:00 CST 2021 1 2020
生物信息 perl 脚本实战

索引 1.统计fasta、fa和fastq文件的长度,统计fastq的reads个数,单个reads长度,reads总长度;统计fasta文件中contig的个数,列出名称,单条的长度,以及总长 ...

Fri Aug 12 00:17:00 CST 2016 0 3716
 
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