VCF和GVCF格式说明
注意：本文的内容主要来自于GATK官网的讲解，所以vcf也是GATK产生的，用其他caller，比如varscan2产生的vcf文件的内容注释可能不一致。 参考：https://gatkforums.broadinstitute.org/gatk/discussion/1268 ...
原文：VCF格式说明
VCF是用于描述SNP，INDEL和SV结果的文件，下面所记录的是以GATK软件结果的VCF文件，与SAMtools的结果有点不同 VCF文件可以分为两部分看，最上面 号注释的的部分是对一些参数的解释 看英文能懂的话，下面的解释就不用看了 ，而下面没 号注释的部分则是各个参数对应的具体的值 一般先关注以下几列信息，从左到右为： CHROM ：染色体编号 POS：参考基因组上variant碱基的位置 ...
2020-01-07 10:33 0 797 推荐指数：
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