miRNA 数据过滤我使用cutadapt 1 cutadapt -a AGATCGGAAGAGCACACGTCT -m 15 -q 20 --discard-untrimmed -o outname .fa --discard-untrimmed 把reads中不含 ...
miRNA分析 数据过滤 一 在比对之前为了减少比对时间,将每一个样本中的reads进行合并,得到fasta格式,其命名规则如下: 样本 r数子 x数字 r 中的数字表示reads序号 x 中的数字表示该条reads重复次数 比对分为两条策略 根据本物种已有的miRNA序列进行比对, 已知当miRNA序列从 miRBase 或者 sRNAanno得到 应该将clean reads比对到所研究物种到 ...
2020-01-04 21:38 1 2159 推荐指数:
miRNA 数据过滤我使用cutadapt 1 cutadapt -a AGATCGGAAGAGCACACGTCT -m 15 -q 20 --discard-untrimmed -o outname .fa --discard-untrimmed 把reads中不含 ...
miRNA分析--数据过滤(一) miRNA分析--比对(二) 根据miRNA Target Prediction in Plants, miRNA并非所有区域都要求严格匹配,其中第1位碱基和第14位以后的碱基是允许错配(以miRNA 5'为始)。 miRNA 文件提交不管是U ...
http://mirgator.kobic.re.kr/help.html ...
最近受人之托研究了下b站的数据爬取做个小工具,最后朋友说不需要了,本着开源共享的原则,将研究成果与大家分享一波,话不多说直接上干货 需求分析 给定up主uid和用户uid,爬取用户在该up主所有视频中发的所有弹幕 需求拆解 获取up主所有视频 打开b站,随便搜索一个up主,打开所有视频 ...
1、简介: 进化生物学是指研究不同生物在一段时期中的改变,其目的是提供理论,进而解释生物多样性的过程和机制。与证据充足的生物学相比,支持进化生物学的确凿证据并不多,往往只能通过 ...
最近由于看基因组文章看的有点兴奋,于是返了个场,学习下micRNA。 下载了一篇自己捯饬的paper,啃了很久还是不是很明白,然后我突然看了一个单词,vivo,原来只以为vivo就是手机只能照亮你的 ...
基于下面这份ppt:Comparing SPM and FSL, by lChris Rorden fsl & spm都是免费的,都很受欢迎。spm更受欢迎。 ...
这是一个尝试性的文章,能不能解决我要解决的问题,并不清楚。 ===本文利用NCBI的blast界面,实现将短序列比对上reference基因组,并实现变异位点可视化。===补言=== 比对常用的是NCBI网站,打开NCBI。(百度 谷歌直接搜索NCBI, 现在中国也在搭建和完善国家生物信息中心 ...