ggplot2 PCA散点图绘制
分别利用颜色（colour）和形状（shape i.e. pch）进行分组很多属性需要单独设置。 用到的对象有 数据映射（Aes，Data aesthetic mappings） 几何属 ...
原文：ggplot2绘制KEGG富集散点图
散点图是 KEGG 富集分析结果的图形化展示方式。在此图中，KEGG 富集程度通过 rich factor, qvalue 和富集到此通路上的基因个数来衡量。其中 rich factor 指差异表达的基因中位于该 pathway 条目的基因数目与所有有注释基因中位于该 pathway 条目的基因总数的比值。Rich factor越大，表示富集的程度越大。qvalue 是做过多重假设检验校正之后的 ...
2020-01-04 16:37 0 6383 推荐指数：
相关推荐
R语言|ggplot2| 绘制KEGG气泡图
在 RStudio 中使用 BiocManager 安装包 安装对应版本的 Rtools 详细指导说明 安装连接 安装完成后，使用命令安装 KEGGREST 以及所需要的相关包 包加载 查看KEGG数据库包含的数据 获取单个数据集中的数据 对单个数据库进行组织 ...
ggplot2绘制GO富集分析柱状图
1.使用clusterProfiler包进行GO富集分析 使用clusterProfiler的enrichGO函数来获取GO分析 可以看到GO富集分析条目一共有769条属于BP,51条属于CC,32条属于MF 2.ggplot2绘制GO分析条目图 1. ...
KEGG富集分析散点图.md
输入数据格式 输出图片 ...
R绘图 第五篇：绘制散点图（ggplot2）
ggplot2包中绘制点图的函数有两个：geom_point和 geom_dotplot，当使用geom_dotplot绘图时，point的形状是dot，不能改变点的形状，因此，geom_dotplot 叫做散点图（Scatter Plot），通过绘制点来呈现数据的分布，对点分箱的方法有两种：点 ...
ggplot2 geom设置—散点图
具体例子 library(ggplot2) p<-ggplot(economics,ae ...
R绘图 第九篇：绘制散点图和气泡图（ggplot2）
绘制散点图（scatterplots）使用geom_point()函数，气泡图（bubblechart）也是一个散点图，只不过点的大小由一个变量（size）来控制。散点图潜在的最大问题是过度绘图：当一个位置或相邻的位置上出现有多个点，就可能把点绘制在彼此之上， 这会严重扭曲散点图的视觉外观 ...
一张图绘制多组散点图和折线图(R:ggplot2)
问题：如何在一张图上面绘制多组散点图和折线图？例如在下面的评分数据中，每轮数据绘制散点图，平均值绘制折线图。 数据（excel）：营业厅评分数据 做法：R语言ggplot函数 library(readxl) library(ggplot2) data<-read_excel ...