原文:haploPS、XP-EHH、 Fst检测正向选择信号的实例介绍

欢迎来到 bio生物信息 的世界 下面是一篇文献介绍。 关于人类基因组正向选择信号的检测分析。 .正向选择的概念 正向选择:某一突变位点逐渐积累,成为优势的位点。 具体表现为:随着时间延长,该位点的突变基因型频率越来越高,远远超过野生型 .正向选择的目的 通过比较驯化 野生动植物 现代智人 灵长类动物 特定人群 参考人群等方式,查找受到正向选择的基因组。 解释受到正向选择的基因组与特定表型的关系。 ...

2020-01-03 18:59 0 1793 推荐指数:

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使用XP-CLR检测基因组中的选择信号

检测基因组选择信号的方法有很多种,其中 XP-CLR 方法是常用的一种。XP-CLR 是陈华老师、Nick Patterson 和 David Reich 在 2010 年发表的方法,全称叫 the cross-population composite likelihood ratio test ...

Sun Jun 14 03:48:00 CST 2020 3 1667
使用Python版XP-CLR检测基因组中的选择信号

上一篇文章 《使用XP-CLR检测基因组中的选择信号介绍XP-CLR。XP-CLR 是一种是基于选择扫荡(selective sweeep)的似然方法。选择扫荡可以增加群体之间的遗传分化,导致等位基因频率偏离中性条件下的预期值。XP-CLR 利用了两个群体之间的多基因座等位基因频率差异 ...

Sun Jun 14 03:50:00 CST 2020 0 598
kail入侵xp实例

Kali的IP地址是192.168.0.112 Windows XP的IP地址是192.168.0.108 本文演示怎么使用Metasploit入侵windows xp sp3。 启动msfconsole: # msfconsole 选择一个漏洞 ...

Thu Jul 02 06:51:00 CST 2020 0 516
Nginx 相关介绍正向代理和反向代理)

参考来源:Nginx 相关介绍(Nginx是什么?能干嘛?) Nginx的产生   没有听过Nginx?那么一定听过它的"同行"Apache吧!Nginx同Apache一样都是一种WEB服务器,基于REST架构风格,以统一资源描述符(Uniform Resources Identifier ...

Tue Jan 11 02:17:00 CST 2022 1 741
linux信号介绍

1.基本概念 中断:   中断是系统对于异步事件的响应   中断信号   中断源   现场信息   中断处理程序   中断向量表 异步事件的响应:进程执行代码的过程中可以随时被打 ...

Mon Nov 28 23:26:00 CST 2016 1 2113
Fst计算

在群体遗传学中衡量群体间的遗传分化的程度的指标有许多种,较为常见的就是遗传分化指数(Fst),fst是由F统计量演变而来,F统计量主要有三种(FIS,FIF,FST)。Fst是针对一对等位基因,如果基因座上存在复等位基因,则需要用Gst衡量,基因差异分化系数(gene ...

Sat Apr 10 01:53:00 CST 2021 0 502
Linux常见信号介绍

1、信号 首先信号我们要和信号量区分开来,虽然两者都是操作系统进程通信的方式。可以简单的理解,信号是用来通知进程发生了什么需要做什么,信号量一般是用作进程同步(pv操作) 2、常见信号量 (以下数字标号代表信号再bitmap中的位置) 2SIGINT 可能使我们最常用的信号之一。一般 ...

Sat Jun 26 18:44:00 CST 2021 0 295
 
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