原文:Annotated LncRNA的实时定量PCR引物设计教程

LncRNA设计原则 LncRNA的引物设计跟mRNA的引物设计类似,都遵循以下规则: .引物应在核酸系列保守区内设计并具有特异性。 .扩增产物长度在 bp。最长不要超过 bp。 .产物不能形成二级结构 自由能小于 . KJ mol 。 .引物长度:一般在 碱基之间,上下游引物不宜相差太大。 .引物自身不能有连续 个碱基的互补,避免形成发卡结构。 LncRNA引物设计 我们通过在线工具Primer ...

2020-01-02 20:26 0 5984 推荐指数:

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Novel LncRNA实时定量PCR引物设计教程

Novel LncRNA的选择 novel LncRNA选择的原则: 1.不能选与其他基因exon重叠的lncRNA,否则,RT-qPCR结果就混合了两个基因的表达量。 2.最好选择基因间的lncRNA,即lincRNA,跟其他基因没有重叠。 3.其次选择位于其他基因intron区域 ...

Fri Jan 03 07:29:00 CST 2020 0 3099
lncRNA表达定量方法评估

见文章:Benchmark of lncRNA Quantification for RNA-Seq of Cancer Samples Overall, 10-16% of lncRNAs can be detected in the samples, with antisense ...

Tue Mar 27 23:42:00 CST 2018 0 881
10.26-qPCR引物设计

设计原则: 1.PCR扩增产物长度 :80-150bp. 引物的产物大小不要太大,一般在80-250bp之间都可;80-150bp最为合适(可以延长至300 bp) 2.引物长度一般在15-30碱基之间。   引物长度(primer length)常用的是18-27bp,但不应大于38bp ...

Wed Oct 27 02:08:00 CST 2021 0 4994
primer3批量设计引物

核心程序调用 Primer3_core,基本用法: primer3_core [ -format_output ] [ -default_version=1|-default_version=2 ...

Fri Aug 17 17:20:00 CST 2018 0 1673
生信-使用NCBI进行目的基因的引物设计

使用NCBI进行目的基因的引物设计 全文概述 利用生信工具进行目的基因的引物设计,使用了NCBI进行筛选与设计引物,使用 idtdna对筛选出的DNA进行检查。本文分享了如何筛选出高质量的基因引物,帮助想通过生信进行引物设计的学生、从业者找出合适的基因,毕竟购买引物也比较烧钱,避免设计出的基因 ...

Mon Nov 25 04:11:00 CST 2019 0 336
TPM 程序设计基础 1-2-4 :新的 PCR 命令

New PCR commands 新的 PCR 命令 注意:本文只提供相关函数的说明、定义、参数、返回值、注释等的简单翻译,对于更多信息、疑问或错误之处,请阅读原英文文档。 Tspi_TPM_PcrReset 重置PCR寄存器。 《TSS V1.2.pdf》 P298 ...

Wed Apr 29 19:18:00 CST 2020 0 719
 
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