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.使用clusterProfiler包进行GO富集分析 使用clusterProfiler的enrichGO函数来获取GO分析 可以看到GO富集分析条目一共有 条属于BP, 条属于CC, 条属于MF .ggplot 绘制GO分析条目图 .按照qvalue升序排序,分别选出前 个BP,CC,MF的条目,由于enrichGO函数生成的数据框默认是按照qvalue升序排序,所以这里我们只用选取前十个就 ...
2020-01-05 18:39 0 9465 推荐指数:
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参考博客 http://blog.sciencenet.cn/blog-3406804-1166293.html 四个参数用于控制坐标轴与作图区域的位置 scale_x_discrete( ...
散点图是 KEGG 富集分析结果的图形化展示方式。在此图中,KEGG 富集程度通过 rich factor, qvalue 和富集到此通路上的基因个数来衡量。其中 rich factor 指差异表达的基因中位于该 pathway 条目的基因数目与所有有注释基因中位于该 pathway 条目的基因 ...
## Gives count, mean, standard deviation, standard error of the mean, and confidence interval ...
如下代码所示: ...
,统计出作图的数据集 4.作图 上面代码解释:在ggplot2中, 所接受 ...
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以下绘图以Weibull分布(韦伯分布、威布尔分布)为例 关于Weibull分布(韦伯分布、威布尔分布),请参考本人博客http://www.cnblogs.com/wwxbi/p/6141501.html library(ggplot2) # 这里的d和y都有大小顺序 d< ...