goseq是一个R包,用于寻找GO terms,即基因富集分析。 GO terms是标准化描述基因或基因产物的词汇,包括三方面,cellular component,molecular funciton,biological process。 每个GO term都有一个GO ID,比如 GO ...
GOseq的介绍 GOseq是一个R包,用于寻找GO terms,即基因富集分析。此方法基于 Wallenius non central hyper geometric distribution。相对于普通的超几何分布 Hyper geometric distribution ,此分布的特点是从某个类别中抽取个体的概率与从某个类别之外抽取一个个体的概率是不同的,这种概率的不同是通过对基因长度的偏好 ...
2019-12-30 22:11 0 2892 推荐指数:
goseq是一个R包,用于寻找GO terms,即基因富集分析。 GO terms是标准化描述基因或基因产物的词汇,包括三方面,cellular component,molecular funciton,biological process。 每个GO term都有一个GO ID,比如 GO ...
Go Modules 不完全教程 文章转载自公众号 Golang 成神之路 , 作者 L Go Modules 是 Golang 官方最近几个版本推出的原生的包管理方式,在此之前,社区也不乏多种包管理方案。在讨论 Go Modules 之前 ...
我们的云平台上的GO富集分析工具,需要输入的文件表格和参数很简单,但很多同学都不明白其中的原理与结果解读,这个帖子就跟大家详细解释~一、GO富集介绍: Gene Ontology(简称GO)是一个国际标准化的基因功能分类体系,提供了一套动态更新的标准词汇表(controlled ...
gin框架教程代码地址: https://github.com/jiujuan/gin-tutorial 我们在用http的时候一般都会用一些web框架来进行开发,gin就是这样的一个框架,它有哪些特点呢 一:gin特点 1、性能优秀2、基于官方的net/http的有限封装 ...
执行命令 查看内存使用情况: go tool pprof http://ip:port ...
使用go mod的方法 单独从大工程里拷出小文件想新建新文件工程时,部分文件路径名报红,出现报错go: cannot determine module path for source directory E:\tttttt (outside GOPATH, no import comments ...
使用clusterProfiler进行GO富集分析原创weixin_43569478 最后发布于2018-11-05 10:06:43 阅读数 12741 收藏展开欢迎关注微信公众号《生信修炼手册》! clusterProfiler是一个功能强大的R包,同时支持GO和KEGG的富集分析 ...
利用DAVID简单的进行GO富集度分析(这里只做简单的分析,即看基因是否存在在GO的三个过程里面) 比如我们有一组要分析的基因:TRPV6 CXADR PROM1 GRAMD2 SOX10 GPRIN2 VANGL2 GRHL1 BCL11A ...