原文:【代谢组学】3.数据分析

非靶向代谢组实验设计 .代谢物提取,一般要求每组至少 个样 .在所有提取好的样本中取等量混合作为QC .QC样本与实验样本穿插上机,开始十个QC,结尾三个QC,中间每十个样本穿插一个QC样本 。 得到质谱谱图数据经软件处理后得到峰表。 峰表格式一般为:每行为一个m z,每列为一个样本 数值表示该样本中某个m z的信号响应。 第一列为保留时间 质荷比来代表离子,如 . . m z。 数据分析流程 一 ...

2019-12-29 22:35 0 5963 推荐指数:

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代谢3.数据分析

目录 非靶向代谢实验设计 数据分析流程 1.数据预处理 2.数据质控 3.统计分析 非靶向代谢实验设计 1.代谢物提取,一般要求每组至少10个样; 2.在所有提取好的样本中取等量混合作为QC; 3.QC样本与实验 ...

Wed Dec 30 19:49:00 CST 2020 0 1297
蛋白质数据分析——(1)原理

当前,关于高通量蛋白质的研究远不如NGS这般火热,网上关于这方面的知识也寥寥无几,从事这一行也有一段时间了,但还没好好总结过。加之过段时间可能要去做培训,所以是时候把知识点总结一下,权当复习。当然整个蛋白质研究也算纷繁复杂,不可能面面俱到,而且很多东西我也在学习当中,肯定会出现不少纰漏 ...

Thu Jul 18 06:59:00 CST 2019 1 9679
代谢】5.功能分析

目的 和转录或蛋白分析原理类似,目的是: 将大量的差异代谢物降维到少量的显著富集的代谢通路,方便解释科学问题; 从通路水平上可以更好解释表型背后的生物原理/过程。 富集分析方法 富集分析的本质:某个代谢通路在不同的状态下(如疾病与健康)是否发生了显著变化? ORA富集 回答的问题 ...

Thu Jan 16 05:54:00 CST 2020 0 1747
代谢】5.功能分析

目录 目的 富集分析方法 ORA富集 FCS富集 工具 目的 和转录或蛋白分析原理类似,目的是: 将大量的差异代谢物降维到少量的显著富集的代谢通路,方便解释科学问题; 从通路水平上可以更好解释表型背后的生物原理 ...

Wed Dec 30 19:52:00 CST 2020 0 429
代谢实验、质控与分析

目录 1.实验及质控 (1)项目流程 (2)非靶代谢质控 (3)靶向代谢质控 (4)代谢全流程质控 2.数据分析挖掘 (1)代谢组分类回顾 (2)数据预处理 (3)定量层面挖掘 ...

Wed Dec 30 19:54:00 CST 2020 0 773
转录数据分析思路

转录紧紧围绕基因表达量和功能分析两部分,结合生物学问题来进行数据分析。 高表达基因已经研究比较透彻,应该更多关注中低表达基因。 层次聚类的妙用: -- 全部基因——>(差异分析)——>根据趋势挑选部分特异性基因——>功能分析; -- 功能大类聚类——> ...

Sun Jul 19 19:45:00 CST 2020 0 2013
蛋白质数据分析笔记汇总

前言 之前本来打算根据自己对蛋白质数据分析的经验和理解写一系列相关教程出来供复习参考,没想到在网上查到别人已经做过了,而且笔记相当全面,从样本处理到质谱仪原理再到数据分析等等都有提及,虽然是2016-2017年的课程,但内容并未过时,对我自己也大有益处。虽然其中一些内容有重复,但我也不想 ...

Thu Nov 07 07:24:00 CST 2019 0 2351
小白数据分析----->如何设计和分析数据指标

今天说到的这个题目,看起来有点大,不过作为游戏数据分析师,早晚都要设计和分析数据指标。在《移动游戏运营数据分析指标白皮书》(http://www.xuefenxi.com/forum.php?mod=viewthread&tid=2&extra=page%3D1)中,提炼了一些针对 ...

Fri Feb 22 01:26:00 CST 2013 2 4051
 
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