原文:如何鉴定全基因组加倍事件(WGD)

目前鉴定全基因组加倍 whole genome duplication events 有 种 通过染色体共线性 synteny 方法是比较两个基因组的序列,并将同源序列的位置绘制成点状图,如果能在点状图中发现比较明显的长片段,切较多,便可以推测是由于大尺度的基因组重复以后保留下来的痕迹,,而一般我们假想这种大尺度的基因组重复往往就是全基因组的重复。同样,对于单个物种而言,我们也可以绘制基因组内部的 ...

2019-12-29 14:55 0 4710 推荐指数:

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Assemblytics鉴定基因组间SV

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基于基因组测序数据鉴定结构变异的四大类算法总结

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WGA(基因组扩增)技术

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PacBio基因组测序和组装

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GWAS基因组关联分析

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Sun Jun 13 23:55:00 CST 2021 0 4672
【GS模型】基因组选择之rrBLUP

目录 1. 理论 2. 实操 2.1 rrBLUP包简介 2.2 实操 3. 补充说明 关于模型 关于交叉验证 参考资料 1. 理论 rrBLUP是基因组选择最常用的模型之一,也是间接 ...

Thu Dec 10 01:01:00 CST 2020 0 948
基因组选择育种(GS)简介

基因组选择(Genomic selection, GS)是一种利用覆盖基因组的高密度标记进行选择育种的新方法,可通过早期选择缩短世代间隔,提高育种值(Genomic Estimated Breeding Value, GEBV)估计准确性等加快遗传进展,尤其对低遗传力、难测定的复杂性状具有较好 ...

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