fasta与fastq格式文件解读
1、FASTA文件的格式 在生物信息学中，FASTA格式（又称为Pearson格式）是一种基于文本的、用于表示核苷酸序列或氨基酸序列的格式。在这种格式中碱基对或氨基酸用单个字母来表示，且允许在序列前添加序列名及注释。 FASTA文件以序列表示和序列作为一个基本单元，各行记录信息如下： 第一 ...
原文：【文件格式】解读sam格式文件
，SAM文件格式介绍 SAM The Sequence Alignment Map format 格式，即序列比对文件的格式，详细介绍文档：http: samtools.github.io hts specs SAMv .pdf SAM文件由两部分组成，头部区和主体区，都以tab分列。头部区：以 开始，体现了比对的一些总体信息。比如比对的SAM格式版本，比对的参考序列，比对使用的软件等。主体区： ...
2019-12-24 16:34 0 1129 推荐指数：
相关推荐
bam/sam 文件格式详解
sam/bam 是一种序列比对格式标准，由sanger制定，是以TAB为分割符的文本格式。主要应用于测序序列mapping到基因组上的结果表示，当然也可以表示任意的多重比对结果。通常是把FASTQ文件格式的测序数据比对到对应的参考基因组版本得到的。 header 部分 sam 分为两部分，注释 ...
ini格式文件
ini文件是Initialization File的缩写，平时用于存储软件的的配置文件。例如：MySQL数据库的配置文件。 例如： [mysqld] datadir=/var/lib/mysql socket=/var/lib/mysql/mysql.sock ...
Parquet 格式文件
Apache Parquet是Hadoop生态圈中一种新型列式存储格式，它可以兼容Hadoop生态圈中大多数计算框架(Hadoop、Spark等)，被多种查询引擎支持（Hive、Impala、Drill等），并且它是语言和平台无关的。Parquet最初是由Twitter和Cloudera ...
orc格式文件
1、Hive支持创建表时指定orc格式即可： 压缩格式有"SNAPPY"和 "ZLIB"两种，需要哪种格式指定即可 2、SPARK支持 Spark读： Spark写： 3、Hadoop Streaming支持 3.1、读orc文件，输出text ...
.ipynb格式文件
ipynb，即ipython notebook，需要用ipython notebook打开，IPython Notebook是web based IPython封装，但是可以展现富文本，使得整个工作可以以笔记的形式展现、存储，对于交互编程、学习非常方便。 如果还是把ipynb文件扔进 ...
.OFF 格式文件
转载：http://blog.sina.com.cn/s/blog_643634b80102v166.html 物体文件格式（.off）文件通过描述物体表面的多边形来表示一个模型的几何结构，这里的多边形可以有任意数量的顶点。 普林斯顿形状 Banchmark ...
csv格式文件
逗号分隔值（Comma-Separated Values，CSV，有时也称为字符分隔值，因为分隔字符也可以不是逗号），其文件以纯文本形式存储表格数据（数字和文本）。 对于这种格式的数据，我们需要利用open函数来读取文件并根据逗号分隔的特点来进行处理。 例如： 股票代码 ...