RNA-seq(9):功能富集分析
这部分开始进行基本的富集分析，两类 A：差异基因富集分析（不需要表达值，只需要gene name） B: 基因集(gene set)富集分析（不管有无差异，需要全部genes表达值 ...
原文：RNA-Seq分析——KEGG富集分析
入学到现在已经有小半年了，最近正好在做RNA Seq的分析，记录一下自己的成长轨迹。 以下是我用clusterProfiler对拟南芥的差异表达基因做的kegg富集分析： 载入需要的R包 library clusterProfiler 载入我用edgeR得到的差异表达基因 load gene all up down.Rdata 对上调基因进行kegg富集分析，并绘制柱状图 y enrichKEGG ...
2019-12-17 21:58 0 1512 推荐指数：
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