使用"biomaRt"包进行基因ID转换
1、安装"biomaRt"包 2、"ensembl_transcript_id_version" 转 "refseq_mrna", "ensembl_gene_id", "hgnc_symbol" 输入文件file.txt如下所示： 转换命令如下： 输出文件new如下所示： ...
原文：bioMart进行基因id的转换
.bioMart包的介绍 bioMart包是一个连接bioMart数据库的R语言接口，能通过这个软件包自由连接到bioMart数据库，这个包可以做以下几个工作： .查找某个基因在染色体上的位置。反之，给定染色体每一区间，返回该区间的基因 .通过EntrezGene的ID查找到相关序列的GO注释。反之，给定相关的GO注释，获取相关的EntrezGene的ID .通过EntrezGene的ID查找到 ...
2019-12-17 15:40 0 9191 推荐指数：
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