群体遗传参数
1 Theta (\( \theta \)) 群体遗传学中，在中性 Wright-Fisher 模型 (neutral Wright-Fisher model) 下，尺度参数为 \[\theta = 4N\mu\] 为每世代平均突变数的两倍。其中，\(N\) 为有效群体大小 ...
原文：群体遗传之ped格式
PED简介 PED文件格式是广泛使用的用于连锁系谱数据分析的格式，并用作plink程序的输入。PLINK是一个免费的，开源的全基因组关联分析工集，旨在以高计算效率的方式执行一系列基本的，大规模的分析。PED能够处理二倍体SNP数据。 空格 空格或制表符 分隔的文本文件 .ped 每一行对应一个individual 以下前 列是必须的 id是字母数字 : o Family ID Family ID ...
2019-12-15 22:38 0 245 推荐指数：
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--out test_out 群体遗传学中，经常提到群体间随机交配，随机交配是Hardy-We ...
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链接：https://www.jianshu.com/p/c489da8e75ff 群体遗传学介绍 传统群体遗传学是基于观察到的等位基因频率与预期频率的分析。例如，在Wright-Fisher模型下，你可能会看到有性繁殖的二倍体个体群体，而且这些种群没有重叠世代。该模型 ...
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