原文:利用vcftools比较两个vcf文件

因为最近有一项工作是比较填充准确性的,中间有用到vcftools比较两个vcf文件。 使用命令也很简单: 运行结束会生成一个名为Diff.site.diff.sites in files的文件: pso ,ref 和alt 代表file .snp.vcf文件中位点信息,IN FILE列代表含有当前snp位置信息的文件, 代表file .snp.vcf含有此位点, 代表file .snp.vcf含有 ...

2019-12-11 20:27 0 342 推荐指数:

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diff 比较两个文件的不同

1.命令功能 diff 逐行比较文件内容,并输出文件差异。 2.语法格式 diff option file1 file2 diff 选项 文件1 文件2 参数说明 参数 参数说明 -y ...

Thu Apr 26 06:12:00 CST 2018 0 4060
mac 比较两个文件

比较两个文件,输出两个文件都有的行,可以 1.使用comm命令 如下例: comm命令会输出三列,第一列为第一个文件单有的行,第二列为第二个文件单有的行,第三列为公有的行。另如果有重复行,并不算一行来区分。 看comm的用法: 可以选择输出那一 ...

Sun Aug 26 07:04:00 CST 2018 0 3521
linux比较两个文件的不同(6/21)

cmp 命令:比较任意两个类型的文件,且吧结果输出到标准输出,默认文件相同不输出,不同的文件输出差异 必要参数 -c 显示不同的信息-l 列出所有的不同信息-s 错误信息不提示 选择参数 -i<字符数> 指定字符数目-v 显示版本信息--help 显示帮助信息 【函数的返回值 ...

Fri Jun 22 07:22:00 CST 2018 0 26238
最快比较两个文件内容

NET CORE下最快比较两个文件内容 最近项目有个需求,需要比较两个任意大小文件的内容是否相同,要求如下: 项目是.NET CORE,所以使用C#进行编写比较方法 文件大小任意,所以不能将文件内容全部读入到内存中进行比较(更专业点说,需要使用非缓存的比较方式) 不依赖第三方库 ...

Sun Jun 23 19:10:00 CST 2019 0 1001
Notepad++中如何比较两个文件

1. 使用Notepad打开需要比较两个文本文件。 2. 点击菜单 Plugins > Compare > Compare 3. 到此为止,即可看到两个文件按照列形式分别高亮显示区别的地方。 注意:这里提到了Compare插件,安装方式如下: 1. 根据该文章,how ...

Mon Apr 11 20:07:00 CST 2016 0 6606
使用Vim比较两个文件的内容

原文地址:http://blog.chinaunix.net/uid-22548820-id-3477464.html 1. 使用vim的比较模式打开两个文件: vim -d file1 file2 或 vimdiff file1 file2 2. 如果已经打开了文件 ...

Thu Jun 15 14:54:00 CST 2017 0 6680
比较两个文件是否相同

比较两个文本文件的差异 win 下 fc 命令 linux 下 diff 命令 比较两个文件是否相同 方法一 方法二 方法三 比较两个图像文件是否相似 方法一 通过计算文件的特质值进性比较。 pHash 方法二 缩小图片后比较像素点 参考链接 ...

Fri May 18 04:38:00 CST 2018 0 1176
 
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