数据预处理（DNA genotyping、Quality control、Imputation） QC的工作可以做PLINK上完成Imputation的工作用IMPUTE2完成 2. 表型数据统计分析 ...

一、为什么要做GWAS的条件分析（conditional analysis） 我们做GWAS的时候，经常扫出一堆显著的信号，假设rs121是我们扫出来与某表型最显著相关的位点（P=1.351e-36），rs124尾随其后(6.673e-22)，也是与该表型显著相关，那么这个时候，我们就有问题 ...

1、软件下载，下载地址：https://github.com/genetics-statistics/GEMMA/releases 下载过程： 2、调用测试 ...

假如你的GWAS结果出现如下图的时候，怎么办呢？GWAS没有如预期般的扫出完美的显著信号，也就没法继续发挥后续研究的套路了。 最近，nature发表了一篇文献“Common genetic variants contribute to risk of rare severe ...

LocusZoom图几乎是GWAS文章的必备图形之一，其主要作用是可以快速可视化GWAS找出来的信号在基因组的具体信息：比如周围有没有高度连锁的位点，高度连锁的位点是否也显著。 下面是locuszoom的示例图： 下面具体讲讲如何实现Locuszoom的绘制 1、进入Locuszoom ...

plink进行阈性状（质量性状）关联分析有两种方法 --assoc 和 --logistic， 这两种方法又分别有分是否校正： --assoc --adjust 和 --logistic --adjust --logistic方法有可以选择是否添加协变量： --logistic ...

问题： 什么是遗传分析genetic analysis？发展逻辑是什么？ 疾病和变 ...

出处：bilibili 关联分析（Association）：在交易数据、关系数据或其他信息载体中 ...