find_circ 识别circRNA 的原理
find_circ 通过识别junction reads 来预测circRNA 和参考基因组比对完之后，首先剔除和基因组完全比对的reads,保留没比对上的reads, 这部分reads 直接比是比对不上基因组的，因为其来自不同的外显子区域，直接比对的话不允许这么大片段的缺失 ...
原文：find_circ的使用教程
find circ鉴定circRNA的原理 find circ 的基本原理: find circ根据Bowtie 比对结果，从没有比对到参考序列的 reads 的两端各提取 nt 的 anchor 序列，将每一对 anchor 序列再次与参考序列比对。如果 anchor 序列的 端比对到参考序列 起始与终止位点分别记为 A ，A ，anchor 序列的 端比对到此位点的上游 起始与终止位点分别记 ...
2019-12-02 22:22 0 360 推荐指数：
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