原文:【宏组学】如何根据taxid(或taxname)快速获得taxname(或taxid)?

需求 我有一个物种taxonomy ID的list,想获得相应的物种名,不要一个个去NCBI Taxonomy官网查。反之根据物种名list查询对应的taxid。 实现 因为之前没怎么用过,我的第一个想法是通过下载到集群的taxonomy数据库文件来匹配。一般下载下来的数据库会有names.dmp和nodes.dmp文件,分别是物种层级关系文件和taxid与物种名对应文件。但我想要的只是speci ...

2019-12-02 13:03 0 357 推荐指数:

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如何根据taxid(或taxname快速获得taxname(或taxid)?

目录 需求 实现 需求 我有一个物种taxonomy ID的list,想获得相应的物种名,不要一个个去NCBI Taxonomy官网查。反之根据物种名list查询对应的taxid。 实现 因为之前没怎么用过,我的第一个想法是通过下载到集群 ...

Wed Dec 30 19:58:00 CST 2020 0 486
【代谢】1.代谢简介

目录 基本概念 代谢学分类与应用 代谢研究意义与优势 代谢学分析流程 代谢常见名词 基本概念 代谢物:所有分子量小于1500Da的小分子物质,包括糖类、核苷、有机酸、酮类化合物、多肽、氨基酸、有机胺类、醛类化合物、脂质、萜类、类固醇 ...

Wed Dec 30 19:46:00 CST 2020 0 529
【代谢】1.代谢简介

基本概念 代谢物:所有分子量小于1500Da的小分子物质,包括糖类、核苷、有机酸、酮类化合物、多肽、氨基酸、有机胺类、醛类化合物、脂质、萜类、类固醇、生物碱、小分子药物等等。 代谢:一个细胞、组织、器官中所有代谢物的集合。 代谢:利用高通量的技术来鉴定和定量一个细胞、组织或器官中所有小 ...

Mon Dec 30 04:33:00 CST 2019 0 4434
通过快速破解EXCEL文件密码

方法: 1\打开文件 2\工具-------录制新---输入名字如:HACKER 3\停止录制(这样得到一个空) 4\工具-------,选HACKER,点编辑按钮 5\删除窗口中的所有字符(只有几个),替换为下面的内容:(复制吧) 6\关闭编辑窗口 7\工具--------,选 ...

Mon Jun 25 18:24:00 CST 2018 0 1015
蛋白质】搜库工具简介与评估

蛋白质数据分析相对较难,不同于常规蛋白质组分析,因为数据库太大,无法直接进行搜库匹配,需要对数据库进行优化。整理了几个发表的蛋白搜库分析工具。具体效果如何,还需要测试。 1.ProteoStorm 发表:ProteoStorm: An Ultrafast Metaproteomics ...

Fri Mar 20 07:00:00 CST 2020 0 1015
代谢实验、质控与分析

目录 1.实验及质控 (1)项目流程 (2)非靶代谢质控 (3)靶向代谢质控 (4)代谢全流程质控 2.数据分析挖掘 (1)代谢组分类回顾 (2)数据预处理 (3)定量层面挖掘 ...

Wed Dec 30 19:54:00 CST 2020 0 773
 
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