目录 需求 实现 需求 我有一个物种taxonomy ID的list,想获得相应的物种名,不要一个个去NCBI Taxonomy官网查。反之根据物种名list查询对应的taxid。 实现 因为之前没怎么用过,我的第一个想法是通过下载到集群 ...
需求 我有一个物种taxonomy ID的list,想获得相应的物种名,不要一个个去NCBI Taxonomy官网查。反之根据物种名list查询对应的taxid。 实现 因为之前没怎么用过,我的第一个想法是通过下载到集群的taxonomy数据库文件来匹配。一般下载下来的数据库会有names.dmp和nodes.dmp文件,分别是物种层级关系文件和taxid与物种名对应文件。但我想要的只是speci ...
2019-12-02 13:03 0 357 推荐指数:
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基本概念 代谢物:所有分子量小于1500Da的小分子物质,包括糖类、核苷、有机酸、酮类化合物、多肽、氨基酸、有机胺类、醛类化合物、脂质、萜类、类固醇、生物碱、小分子药物等等。 代谢组:一个细胞、组织、器官中所有代谢物的集合。 代谢组学:利用高通量的技术来鉴定和定量一个细胞、组织或器官中所有小 ...
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