GWAS: 曼哈顿图，QQ plot 图，膨胀系数（ manhattan、Genomic Inflation Factor）
画曼哈顿图和QQ plot 首推R包“qqman”，简约方便。下面具体介绍以下。 一、画曼哈顿图 install.packages("qqman") library(qqman) 1、准备包含SNP, CHR, BP, P的文件gwasResults ...
原文：如何画出高级感的曼哈顿图，Manhattan++工具介绍
欢迎来到 bio生物信息 的世界 BMC Bioinformatics前几天发布了一个画曼哈顿图的工具Manhattan , 这个名字很好理解，Manhattan的升级版。 这个工具与之前画曼哈顿图的工具有什么区别呢。 最大的特点是能将显著的位点以及注释信息显示在曼哈顿图上。 可视化很漂亮，特别有高级感。 好了，以下进入主题，讲讲怎么画这个图。 准备需要的输入文件 需要的输入文件有三个，分别是in ...
2019-12-01 16:10 0 668 推荐指数：
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GWAS | 原理和流程 | 全基因组关联分析 | Linkage disequilibrium (LD)连锁不平衡 | 曼哈顿图 Manhattan_plot | QQ plot
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R语言制作曼哈顿图 Q-Q图等
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