原文:ChIP-seq | ATAC-seq | RNA-seq | 数据分析流程

补充RNA seq流程 以前都是自己搭RNA seq流程,虽然可以完成任务,但是数据量一多,批次多起来,就非常难管理。 既然别人提供了这么好的流程,那就要用起来,管理起来不是一般的轻松。 ENCODE DCC rna seq pipeline 安装比较麻烦,没有针对local的一键安装,但我们可以借鉴Dockerfile文件里面的安装方法。 也可以模仿chip seq pipeline scrip ...

2019-12-10 09:57 0 1272 推荐指数:

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Seq数据分析流程RNA

文章目录 RNA-seq 数据分析流程 相关软件安装 下载数据 sra转fastq格式 数据质控 数据质控,过滤低质量reads,去接头 比对 ...

Wed Jul 07 02:14:00 CST 2021 0 216
RNA-seq 基本分析流程

高通量测序技术,就是二代测序,已经成为现代生物学研究的一个较为常规的实验手段。这一技术的发展极大地推动了基因组学,表观基因组学以及翻译组学的研究。RNA-seq 通过测定稳定状态下的RNA样品的序列来对RNA样品进行研究,从而避免了许多之前研究手段的不足,比如象基因芯片或者 PCR 就需要背景知识 ...

Wed Feb 27 02:20:00 CST 2013 2 14247
 
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