deconstructSigs|探寻cosmic的独特“气质”-mutation signature ！
deconstructSigs-mutation signature看一下你的数据是什么“气质”的？ 本文首发于“生信补给站” https://mp.weixin.qq.com/s/k7yzk9hPX3Bi-ohAo83ZYw 还有其他 R统计 绘图 生信的干货，也许有需要 ...
原文：结合自己做过的数据，对cosmic signature理解
分析WGS的mutation时，我用pyclone将mutations聚成了四类。我试图解释每一类的含义，比如：致病的变异 耐药的变异 治疗敏感的变异.... cosmic signature呢，每个样本都有 个signature的信息，假设有 个样本。用NMF或PCA将这些聚成了 类，即 个signatue。 然后，寻找每个signature与什么表型有关系。比如：已知aging的signatu ...
2019-11-21 11:18 0 277 推荐指数：
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