原文:字符串与模式匹配算法(六):Needleman–Wunsch算法

一 Needleman Wunsch 算法 尼德曼 翁施算法 英语:Needleman Wunsch Algorithm 是基于生物信息学的知识来匹配蛋白序列或者DNA序列的算法。这是将动态算法应用于生物序列的比较的最早期的几个实例之一。该算法是由 Saul B. Needlman和 Christian D. Wunsch 两位科学家于 年发明的。本算法高效地解决了如何将一个庞大的数学问题分解为一 ...

2019-11-19 22:52 0 347 推荐指数:

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字符串模式匹配算法(五):BMH算法

一、BMH算法介绍   在BM算法的实际应用中,坏字符偏移函数的应用次数要远远超过好后缀偏移函数的应用次数,坏字符偏移函数在匹配过程中起着移动指针的主导作用。在实际匹配过程,只是用坏字符偏移函数也非常有效。1980年,奈杰尔·豪斯普(Nigel Horspool)提出了改进的BM算法,也就 ...

Mon Nov 18 07:41:00 CST 2019 0 268
字符串模式匹配算法2 - AC算法

上篇文章(http://www.cnblogs.com/zzqcn/p/3508442.html)里提到的BF和KMP算法都是单模式匹配算法,也就是说,模式只有一个。当需要在字符串中搜索多个关键字(模式)时,则需要用到多模式匹配算法。 简介 AC(Aho-Corasick)算法 ...

Sun Jan 19 07:44:00 CST 2014 3 4820
算法模式匹配算法

  (又称字符串)是由n(n≥0)个字符组成的有限序列,它是数据元素为单个字符的特殊线性表。可以用顺序存储方式或者链式存储方式进行存储。模式匹配最重要和最复杂的一个操作,其实也就是的查找,其中Brute-Force算法和KMP算法是两种最经常使用的顺序存储结构下的模式匹配算法 ...

Thu Apr 11 23:02:00 CST 2019 0 3962
Java数据结构之字符串模式匹配算法---Brute-Force算法

模式匹配字符串匹配问题中,我们期待察看源 “ S ” 中是否含有目标T ” (也叫模式)。其中 S被称为主T被称为子串。 1、如果在主中查找到子串,则称为模式匹配成功,返回模式的第一个字符在主中出现的位置。 2、如果在主中 ...

Mon Oct 31 01:31:00 CST 2016 0 5307
字符串模式匹配算法1 - BF和KMP算法

字符串S中定位/查找某个子字符串P的操作,通常称为字符串模式匹配,其中P称为模式模式匹配有多种算法,这里先总结一下BF算法和KMP算法。 注意:本文在讨论字符位置/指针/下标时,全部使用C语法,即下标从0开始。 BF算法 BF(Brute Force)算法也就是传说中的“笨办法 ...

Wed Jan 08 02:49:00 CST 2014 0 11085
Java数据结构之字符串模式匹配算法---KMP算法

本文主要的思路都是参考http://kb.cnblogs.com/page/176818/ 如有冒犯请告知,多谢。 一、KMP算法   KMP算法可以在O(n+m)的时间数量级上完成串的模式匹配操作,其基本思想是:每当匹配过程中出现字符串比较不等时,不需回溯指针,而是利用已经得到的“部分匹配 ...

Mon Nov 14 04:22:00 CST 2016 0 2382
字符串模式匹配算法系列(一):BF算法

算法背景: BF(Brute Force)算法,是一种在字符串匹配算法中,比较符合人类自然思维方式的方法,即对源字符串和目标字符串逐个字符地进行比较,直到在源字符串中找到完全与目标字符串匹配的子字符串,或者遍历到最后发现找不到能匹配的子字符串算法思路很简单,但也很暴力。 算法原理: 假设 ...

Thu Jul 25 00:33:00 CST 2019 0 1372
模式匹配算法---RK

这一节介绍一下由Rabin和Karp提出的RK算法。 1,RK算法的基本思想 HASH! 如果两个字符串hash后的值不相同,则它们肯定不相同;如果它们hash后的值相同,它们不一定相同。 RK算法的基本思想就是:将模式P的hash值跟主S中的每一个长度 ...

Fri May 25 05:43:00 CST 2012 0 6809
 
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