blast+本地化中blastp操作(基于PDB库)—linux
blast+本地化的构建对于流程化处理大量数据序列很方便，blast+是将blast模块化，分为了蛋白质序列比对蛋白数据库(blastp)、核酸序列比对核酸数据库(blastn)、核酸序列比对蛋白质数据库(blastx)、蛋白质比对翻译后的核酸数据库(tblastn)、 翻译后的核酸序列比对翻译 ...
原文：Linux下BLAST+的本地化（BLAST 2.2.29+）
链接：http: blog.sciencenet.cn home.php mod space amp uid amp do blog amp quickforward amp id Linux下BLAST 的本地化 NCBI BLAST . . : . 下载软件BLAST: 在以下网址 ftp: ftp.ncbi.nlm.nih.gov blast executables blast LATES ...
2019-11-11 16:14 0 538 推荐指数：
相关推荐
BLAST在Windows系统中本地化
简介 NCBI除了提供在线的Web BLAST序列比对服务外，还提供FTP方式下载序列比对工具。这允许在本地平台上针对从NCBI下载或本地创建的数据库执行BLAST搜索。这些实用程序没有图形用户界面，通过类似DOS的命令窗口运行，并通过基于文本的命令行开关接受输入 ...
比对软件Blast，Blast+，Diamond比较
1. Blast （1）格式化数据库 formatdb -i db.seq -p T -o T -l logfile 主要参数： -i 输入需要格式化的源数据库名称 -p 文件类型，是核苷酸序列数据库（F - nucleotide）/蛋白质序列数据库（T – protein ...
blast+安装及简单使用
软件下载 BLAST+的一般用法如下： 格式化数据库 参数说明: -in：待格式化的序列文件 -dbtype：数据库类型，prot或nucl -out：数据库名 蛋白序列比对蛋白数据库（blastp） 参数说明: -query： 输入文件路径及文件名 -out：输出文件路径 ...
BLAST+中makeblastdb参数详解
以后打算工作中用到的相关BLAST操作全部用BLAST+来完成 与以前的Blast相以，我们还是从格式化数据库到比对开始 一般我们是有一个fasta文件用来格式化数据库，以前的命令是formatdb，现在是makeblastdb 一般用到的格式如下： makeblastdb ...
blast的本地简单运行
一、软件配置 curl -O ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/ncbi-blast-2.6.0+-x64-linux.tar.gz tar zxvf ...
ncbi-blast 本地安装
详见：http://blog.shenwei.me/local-blast-installation/ Linux系统中NCBI BLAST+本地化教程 本文面向初学者（最好还是懂得基本的linux使用），高手可直接忽视。不介绍Windows系统中的安装方法 ...
blast 本地安装和使用教程
://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/ 这里我下载的 ...