GC偏好的校正与偏好程度的评估
在二代测序仪上测出的数据，通常都会表现出测序深度与GC 含量的相关性，称为GC bias。 GC bias校正 为了后续生物信息分析更加准确，通常需要做GC bias的校正。 2010 年 steven Quake 在Noninvasive diagnosis of fetal ...
原文：GC偏好
GC偏好 测序中的GC偏好指的是基因组上GC含量在 左右的区域更容易被测到，产生的reads更多，这些区域的覆盖度更高， 在高GC或者低GC区域，不容易被测到，产生较少的reads，这些区域的覆盖度更少。 用基因组单位长度的bin中的GC含量作为横坐标，覆盖度作为纵坐标作图，可以明显的看到该趋势。这种趋势在 kb为单位的bin中依然存在。如图A中可以看出随着GC含量的增加，counts是先增加后减 ...
2019-10-31 19:18 0 554 推荐指数：
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