原文:blast+本地化中blastp操作(基于PDB库)—linux

blast 本地化的构建对于流程化处理大量数据序列很方便,blast 是将blast模块化,分为了蛋白质序列比对蛋白数据库 blastp 核酸序列比对核酸数据库 blastn 核酸序列比对蛋白质数据库 blastx 蛋白质比对翻译后的核酸数据库 tblastn 翻译后的核酸序列比对翻译后的核酸数据库 tblastx BLAST 链接地址: ftp: ftp.ncbi.nlm.nih.gov bla ...

2019-10-29 15:24 0 528 推荐指数:

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BLAST在Windows系统本地化

。 以下内容介绍了在运行Windows 7操作系统的PC上安装BLAST+和示例NCBI数据所需的 ...

Mon Aug 06 04:57:00 CST 2018 0 4302
BLAST+makeblastdb参数详解

以后打算工作中用到的相关BLAST操作全部用BLAST+来完成 与以前的Blast相以,我们还是从格式化数据库到比对开始 一般我们是有一个fasta文件用来格式化数据库,以前的命令是formatdb,现在是makeblastdb 一般用到的格式如下: makeblastdb ...

Mon Aug 07 00:14:00 CST 2017 0 1670
比对软件BlastBlast+,Diamond比较

1. Blast (1)格式化数据库 formatdb -i db.seq -p T -o T -l logfile 主要参数: -i 输入需要格式的源数据名称 -p 文件类型,是核苷酸序列数据(F - nucleotide)/蛋白质序列数据(T – protein ...

Thu Feb 28 06:15:00 CST 2019 0 2266
blast+安装及简单使用

软件下载 BLAST+的一般用法如下: 格式化数据库 参数说明: -in:待格式的序列文件 -dbtype:数据类型,prot或nucl -out:数据名 蛋白序列比对蛋白数据blastp) 参数说明: -query: 输入文件路径及文件名 -out:输出文件路径 ...

Fri Mar 06 18:33:00 CST 2020 0 4705
BootstarpBlazor 之 本地化

,BootstarpBlazor(以下简称BB)的本地化和Abp的本地化有所冲突,导致Abp的本地化失效, ...

Tue Aug 03 16:37:00 CST 2021 3 198
bootstrapCDN和本地化

  因为公司网络环境较差和自己是菜鸟的原因,很简单的事情折腾了不少时间。测试开发的网页时候 更新速度总是很慢,这跟使用bootstrapCDN有关系,因为每次更新,它都要重新访问cdn.bootstrap.com一遍,所以需要响应时间。如果网络速度快当然,不需要本地化,否则还是本地化资源 ...

Thu Dec 10 19:55:00 CST 2015 0 4589
IconFont本地化

开发遇到网站需要在专网下使用,需要将IconFont本地化。在这里介绍一种个人觉得最简便的方法 我用的是umi, ant design框架 1.去官网,下载IconFont的JS 下载,在下载的文件中选择JS文件,复制到所在项目的config目录 ...

Fri Apr 24 00:40:00 CST 2020 0 680
 
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