NCBI的gene id, ENTREZID 与Ensembl Gene ID 互相转换网站:https://biodbnet-abcc.ncifcrf.gov/db/db2db.php 还有另外一个单向 ensemble 转NCBI的:https ...
gene symbol: TP gene ID: 。Entrez Gene ID,它是目前国际上最权威的Gene ID编号 GENECODE:GENECODE来自Ensembl数据库。没有ID。它有gtf文件。 HGNC 人类基因命名委员会 只对人类基因进行命名。 HUGO Gene Symbol:HUGO Gene Symbol 也叫做HGNC Symbol,即基因符号 是HGNC组织对基因进行 ...
2019-10-15 08:50 0 1688 推荐指数:
NCBI的gene id, ENTREZID 与Ensembl Gene ID 互相转换网站:https://biodbnet-abcc.ncifcrf.gov/db/db2db.php 还有另外一个单向 ensemble 转NCBI的:https ...
如果转载,请注明出处。 GSEA、David与KEGG、GO数据库的区别: 1.KEGG数据库、GO数据库是知识库。它们记录了通路、生物学过程等的信息。 2.GSEA、David是做富集分 ...
为了查找某个研究领域的相关信息,生物学家往往要花费大量的时间,更糟糕的是,不同的生物学数据库可能会使用不同的术语,好比是一些方言一样,这让信息查找更加麻烦,尤其是使得机器查找无章可循。Gene Ontology就是为了解决这种问题而发起的一个项目。 Gene Ontology中最基本的概念 ...
研究人员针对 PTEN 这个关键的抑癌基因,来探究调控该基因表达的ceRNA 网络; 分析策略: 1)预测能调控该基因的miRNAs 通过miRanda 软件预测和实验验证相结合的方式,挑选 ...
很多网站对基因结构的描述不清晰或不准确,此处给出较为权威的基因结构: ...
1、基因系列中的data索引 2、基因ID之间的转换 对于生信,依托于别人的工具不如自己动手,由于研究发表的滞后性,往往很多工具提供的转换并不是最新的,况且开发者水平也参差不齐,理解原理才能让你来去自如。 今天主要记录几个ID转换的方式: 以果蝇为例 详细的了解阅读下面:ftp ...
Gene Ontology (GO) 注释 Posted on 2017-06-11 | In 生信 相似的基因在不同物种中,其功能往往保守的。显然,需要一个统一的术语用于描述这些跨物种的同源基因及其基因产物的功能,否则,不同的实验室对相同的基因的功能的描述不同,将极大限制学术 ...