R语言学习 - 热图绘制heatmap
生成测试数据 绘图首先需要数据。通过生成一堆的向量，转换为矩阵，得到想要的数据。 data <- c(1:6, 6:1, 6:1, 1:6, (6:1)/10, ( ...
原文：[R] 如何绘制各样本的pathway丰度热图？
前言 一般而言，我们做完pathway富集分析，就做下气泡图或bar图来进行展示，但它们实际上只考虑了富集因子和Pvalue。如果我们不关注这两个因素，而是在乎样本本身的pathway丰度呢 对于KEGG热图绘制，大部分是做到KO层级，因为基因 蛋白和KO的绝大部分都是一对一的对应关系。如果一定要做Pathway的丰度热图呢 一般的方法是将该通路中的基因 蛋白的丰度进行累加来表示该pathway的 ...
2019-10-14 16:32 0 706 推荐指数：
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概率热图的绘制--gradcam
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各种各样的轮播图
轮播图 接触jquery也有一段时间了，今天刚好利用轮播图来练练手。博文的前面会介绍一个简单用jquery做轮播图的例子，中间会插入一些关于轮播图更多的思考，在后面会用Javascript的方法来写一个轮播图，最后则是关于jquery和Javascript的比较。轮播图的效果可以点击如下链接查看 ...
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无论是直方图还是经验分布图，要从比较上鉴别样本是否处近似于某种类型的分布是困难的 QQ图可以帮我们鉴别样本的分布是否近似于某种类型的分布 R语言，代码如下： > qqnorm(w);qqline(w)> w <- c(75.0, 64.0 ...
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RNA_seq 热图绘制
若已经拿到表达矩阵exprSet 若差异较大，进行log缩小不同样本的差距 1、热图全体 2、对差异基因进行绘制，步骤都类似，在进行绘制时，应对数据进行一定处理 3、rlog 进行数据标准化 标准化和raw count ...
R绘制韦恩图 | Venn图
解决方案有好几种： 网页版，无脑绘图，就是麻烦，没有写代码方便 极简版，gplots::venn 文艺版，venneuler，不好安装rJava，参见Y叔 酷炫版，VennDiagram 特别注意： 目前主流的韦恩图都只支持5个类别，多了不能使用韦恩图。 UpSet ...