原文:无标定量|有标定量|谱图计数|XIC|AMT数据库|RT对对齐|母离子|子离子|SILVER|SRM|iBAQ|APEX|差异蛋白筛选|MaxQuant|PANDA|C-HPP

生物医学大数据 蛋白质定量 现今肽段定量效率存在巨大差异。比如相同质量蛋白质,但是肽段和蛋白信号不均一,在物理条件一致时,仅有 的重复率,并且当重复次数变多时,overlapping在变少。 无标定量法 方法一是针对二级色谱的谱图计数,即统计二级色谱的数量,数量越多则蛋白丰度越高,但相同丰度蛋白也有不同的二级色谱数,所以算法目的是减少噪音。 方法二是针对一级色谱的离子流色谱峰XIC,即每个肽段的离 ...

2019-10-13 17:47 0 356 推荐指数:

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【6】蛋白质组学鉴定定量软件之MaxQuant

目录 1.简介 2.下载安装 3.配置与运行 4.结果 5.Perseus后处理 6.小结 1.简介 2016年,德国马普所的Cox和蛋白质组学领域巨擘Matthias Mann合作开发了MaxQuant软件(MQ),并发表在nbt ...

Sat Aug 29 07:48:00 CST 2020 1 7725
蛋白组学定量值得比较说明

1. MaxquantiBAQ和LFQ,该用哪个?我们使用Maxquant做Label Free蛋白质组学定量分析的时候,在Maxquant的参数设置时,会遇到两个参数,LFQ和iBAQ,那么,选择哪个好呢?如果你都选上,在最终的proteingroups.txt中,会出现三列 ...

Mon Oct 21 21:04:00 CST 2019 0 1368
【5】蛋白质组学鉴定定量软件之PD

目录 1.简介 2.安装与配置 3.分析流程 4.结果 1.简介 PD全称Proteome Discoverer,是ThermoFisher在2008年推出的商业Windows软件,没错,收费,还不菲。而且主要也是针对他们家的obitrap产出数据 ...

Sat Aug 29 05:33:00 CST 2020 0 1961
SIMS(secondary ion mass spectroscopy)二次离子

1.仪器介绍 二次离子(SIMS)是一种用于通过用聚焦的一次离子束溅射样品表面并收集和分析喷射的二次离子来分析固体表面和薄膜的组成的技术。SIMS是最灵敏的表面分析技术,元素检测限为百万分之几到十亿分之一。 Schematic of a typical dynamic SIMS ...

Sun Oct 14 23:36:00 CST 2018 0 906
离子烫攻略

一. 背景:中秋节在家,学一下如何做离子烫发,帮老婆做一下离子烫,希望可以成功. 二.材料:资生堂发膏堂热烫软化剂400ml+资生堂烫发水定型柔顺剂400ml 三.操作流程:1.洗发水洗净头发(勿用护发素),用毛巾擦至约7成干先把软化剂挤出放在调和碗里. 2.将头发梳顺,并用分区夹 ...

Sat Oct 09 18:09:00 CST 2021 0 128
离子喷涂

定义:一种材料表面强化和表面改性的技术; 功能:使基体表面具有耐磨、耐蚀、耐高温氧化、电绝缘、隔热、防辐射、减磨和密封等性能; 原理:采用由直流电驱动的等离子电弧作为热源,将陶瓷、合金、金属等材料加热到熔融或半熔融状态,并以高速喷向经过预处理的工件表面而形成附着牢固的表面层的方法 ...

Wed Feb 16 23:15:00 CST 2022 0 1398
NCB | 定量蛋白质组学揭示细胞外泌体通用标志物Syntenin-1

外泌体 (exosomes) 是由哺乳动物细胞通过“内吞-融合-外排”等机制,主动向胞外释放的纳米级 (直径40~60 nm) 双层囊泡小体,携带蛋白质、核酸、脂质等多种生物活性分子。越来越多的证据表明,外泌体是细胞间交流的重要媒介,它们可以将功能性分子转移到受体细胞中,或参与受体细胞膜受体介导 ...

Wed Aug 11 23:56:00 CST 2021 0 167
 
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