原文:txt文件转为fasta文件

inf media disk CJX Genechi chi sum test.txt outf media disk CJX Genechi chi sum test .txt def readwrite inf,outf : f open inf, r out open outf, w next f 不要第一行 for line in f.readlines : list line line. ...

2019-10-10 22:11 0 919 推荐指数:

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fasta文件拆分与合并

Linux中fasta文件的拆分与合并 FASTA文件的拆分: (1)如果从一个文件a提取第11至20个序列存到另一个文件b: awk -v RS='>' 'NR>1{i++}i>=10&&i<=21{print "> ...

Wed Mar 23 20:29:00 CST 2016 0 3529
FASTA文件分割

FASTA格式是一种用于记录序列的文本格式,在生信分析中经常会用到.fasta文件中往往储存成千上万条序列,而在某些时候,需要对文件进行分割,如分割成每个序列一个文件,或分割成较小的fasta文件 假如有如下数据: Tricas1.fasta $ head Tricas1.fasta ...

Fri Feb 22 23:29:00 CST 2019 0 1208
excel转为txt文件 简单代码

package cn.com.mcd.util; import java.io.File;import java.io.FileInputStream;import java.io.FileOutp ...

Mon Mar 20 23:45:00 CST 2017 0 1356
MATLAB中将mat文件转为txt格式文件

直接保存为txt文件: 可以用fprintf函数,来代替save函数 比如现在我有一个变量a=[0.1223 345.4544] 如果我想保存它的话,可以用下面的程序: fid = fopen('a.txt','wt'); fprintf(fid,'%6.4f %8.4f\n ...

Tue Apr 24 18:47:00 CST 2018 0 5187
fasta文件中序列的排序

同样的名为read_1.fa 的fasta文件,里面有若干序列,如: > ...

Thu May 18 06:03:00 CST 2017 0 1322
Linux文件排序和FASTA文件操作

文件排序 seq: 产生一系列的数字; man seq查看其具体使用。我们这使用seq产生下游分析所用到的输入文件。 # 产生从1到10的数,步长为1 $ seq 1 10 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 # 产生从1到10的数,步长为1,用空格分割 ...

Sun Aug 27 05:38:00 CST 2017 0 1513
 
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