原文:Forest plot(森林图) | Cox生存分析可视化

本文首发于 生信补给站 微信公众号,https: mp.weixin.qq.com s W W JKTM S nml VF w 更多关于R语言,ggplot 绘图,生信分析的内容,敬请关注小号,给您干货。 Meta分析的结果使用森林图进行可视化展示很常见,其实COX生存分析也能用森林图展示。 之前分享过绘制KM曲线R 生存分析 ,诺莫图展示COX结果Nomogram 诺莫图 Logistic C ...

2019-10-08 22:47 0 2644 推荐指数:

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Cox回归模型【生存分析

参考:《复杂数据统计方法——基于R的应用》 吴喜之 在生存分析中,研究的主要对象是寿命超过某一时间的概率。还可以描述其他一些事情发生的概率,例如产品的失效、出狱犯人第一次犯罪、失业人员第一次找到工作、青少年第一次吸毒等等。 生存函数S(t): S(t)=P(T>t)=1-P(T< ...

Tue Oct 04 21:02:00 CST 2016 0 13413
python可视化---plot()函数

函数功能:展现变量的趋势变化。 调用签名:plt.plot(x, y, ls="-", lw=2, label="plot figure") x: x轴上的数值 y: y轴上的数值 ls:折线图的线条风格 lw:折线图的线条宽度 label:标记图内容的标签文本 代码实现: ...

Fri Mar 01 00:12:00 CST 2019 0 12264
R语言代写生存分析数据分析可视化案例

目标 本文的目的是对如何在R中进行生存分析进行简短而全面的评估。关于该主题的文献很广泛,仅涉及有限数量的(常见)问题/特征。可用的R包数量反映了对该主题的研究范围。 R包 可以使用各种R包来解决特定问题,并且还有替代功能来解决常见问题。以下是本次 ...

Tue Jun 25 01:00:00 CST 2019 0 521
生存分析(Kaplan-Meier,Cox Regression)

一、背景   在某些场景下我们要判断一个事件能存活多久,这时候我们就需要使用生存分析相关的方法。例如,一些实验中小白鼠在某个时间段的生存概率;或者在日常的打车场景中,一个乘客呼叫了订单,这个订单在等待时间段中的存活概率。 二、风险函数、生存函数与删失数据   假设一个乘客发了一个打车 ...

Mon Sep 21 23:18:00 CST 2020 0 1296
plot3d网格读取写入与可视化

目录 说明 对于程序的说明 源码 说明 plot3d格式是NASA制定并大量使用的CFD网格文件格式,在CFD编程过程中经常涉及到。本文利用Python语言编写一个读取plot3d文件,写入plot3d文件的通用类,并利用vtk完成网格的显示 ...

Tue Jul 16 05:55:00 CST 2019 0 1242
NLP(十二)依存句法分析可视化分析

  依存句法分析的效果虽然没有像分词、NER的效果来的好,但也有其使用价值,在日常的工作中,我们免不了要和其打交道。笔者这几天一直在想如何分析依存句法分析的结果,一个重要的方面便是其可视化和它的分析。   我们使用的NLP工具为jieba和LTP,其中jieba用于分词,LTP用于词性标注 ...

Tue Jul 30 07:08:00 CST 2019 0 2143
 
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