原文:系统发育树处理

PAUP PAUP 简约法和其他方法的亲缘分析 是由简约法 最大似然法和距离法用于亲缘分析的程序,为系统发育分析提供一个简单的,带有菜单界面的,与平台无关的,拥有多种功能 包括进化树图 的程序。 WINIPAUP . PAUP软件WINDOWS介面软件。 Phylip . 进行进化树分析。它可以分析DNA与蛋白序列, 限制位点等,并可绘制进化树。程序含有许多选项可以精确控制与分析。 TreeVi ...

2019-10-05 21:14 0 429 推荐指数:

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系统发育理论基础

地位,使得进化生物学发生了一场革命性的变革。 其中共同祖先学说是构建系统发育的理论基础(p ...

Sun Jul 16 04:32:00 CST 2017 0 5132
系统发育(进化)绘制小结

目录 1.分析软件 2.进化美化和注释 2.1 iTOL美化 2.2 ggtree 1.分析软件 很多很多软件,最常用的有: MEGA PHYLIP 构建进化一般的步骤是:序列比对,构(距离法,独立元素 ...

Tue Oct 27 03:57:00 CST 2020 0 2325
系统发育构建算法和软件

文章转载于 Original 2017-07-08 Berlin 生信百科 (1)距离法 对于UPGMA现在已经很少见了,我只有在处理SSR数据的时候分析过一次,ME的方法不适用于物种数目较多的时候,计算时间较长。因此在这里以邻接法,NJ(Neighbor-Joining ...

Sun Jul 16 04:48:00 CST 2017 0 5482
基于序列比对的系统发育分析

1、简介: 进化生物学是指研究不同生物在一段时期中的改变,其目的是提供理论,进而解释生物多样性的过程和机制。与证据充足的生物学相比,支持进化生物学的确凿证据并不多,往往只能通过 ...

Fri Oct 19 21:09:00 CST 2018 0 2616
通用权限管理系统之权限菜单zTree的展示及移动的处理方法

在通用权限管理系统中,有很多数据结构是有父子关系的,如组织机构,部门,权限菜单等,在展示的时候,大多数是通过zTree的形式展现的,如下: 权限菜单展示 这种数据后台输出比较容易处理,参考如下获取某个子系统的全部操作菜单: 后台输出zTree的数据 前端的JS部分 ...

Wed Mar 02 04:09:00 CST 2016 4 7626
基于前缀的红点系统

一.简介   1.说明     本文为游戏中使用的红点系统的分析,该红点系统基于前缀完成,代码来源于GitHub开源项目:GitHub - HNGZY/RedDotSystem: 基于前缀数的红点系统。在阅读源码的过程中添加了很多注释,也进行了一些小改动,下面粘贴的源码都是经过我的修改 ...

Sun Jun 13 08:47:00 CST 2021 0 1226
模型们是如何处理缺失值的?

模型缺失值处理总结 除了ID3算法之外,其他的模型基本上都能够处理缺失值。虽然如此,但如scikit-learn之类的库,其在支持gbdt的时候,并没有支持缺失值的处理 C4.5 第一步,计算所有特征的信息增益或者信息增益率的时候,假设数据集一共10000个样本,特征A中缺失 ...

Sat Aug 22 20:20:00 CST 2020 0 970
 
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