原文:单细胞转录组测序技术及各类数据分析方法总结

自从 年单细胞转录组测序 single cell RNA seq,scRNA seq 技术首次问世,至今已经有几十种不同的scRNA seq技术相继被开发出来。在过去的十年里,单细胞转录组测序技术得到了蓬勃的发展,从而使得可在单细胞水平揭示全基因组范围内所有基因的表达情况,可以更精准的开展细胞间的表达异质性研究 鉴定新的细胞亚型 解析早期胚胎的发育等。 单细胞测序流程 图片来源 :http: le ...

2019-09-17 12:35 0 1696 推荐指数:

查看详情

单细胞转录测序技术原理

From: https://mp.weixin.qq.com/s/4dtXwK1KTLXndGvO5m2BEQ 单细胞测序主要涉及单细胞基因测序转录测序两个方面,分别针对单细胞DNA及RNA进行序列分析和比较。单细胞测序一直是科学家关注的一个热点。单细胞基因测序目前主要有两种扩增方法 ...

Wed Jun 30 17:19:00 CST 2021 0 525
单细胞测序数据的差异表达分析方法总结

无论是传统的多细胞转录测序(bulk RNA-seq)还是单细胞转录测序(scRNA-seq),差异表达分析(differential expression analysis)是比较两不同样本基因表达异同的基本方法,可获得一样本相对于另一样本表达显著上调(up-regulated)和下调 ...

Sat Sep 07 22:42:00 CST 2019 0 2592
单细胞转录测序技术(scRNA-seq)及细胞分离技术分类汇总

单细胞测序流程(http://learn.gencore.bio.nyu.edu) 在过去的十多年里,高通量测序技术被广泛应用于生物和医学的各种领域,极大促进了相关的研究和应用。其中转录测序(RNA-seq)被广泛应用于测定和描绘各类物种的基因或转录 ...

Sat Sep 07 23:23:00 CST 2019 0 1442
scRNA-seq单细胞测序数据分析工具汇总

本文总结自一篇综述: Computational approaches for interpreting scRNA-seq data 单细胞分析分为两个层次: cell level gene level Tools for the visualization ...

Thu Jul 13 02:13:00 CST 2017 0 6366
单细胞转录CNV分析

什么是CNV? copy number variation (CNV) A copy number variation (CNV) is when the number of copies of ...

Fri May 07 22:49:00 CST 2021 0 210
转录数据分析思路

转录紧紧围绕基因表达量和功能分析两部分,结合生物学问题来进行数据分析。 高表达基因已经研究比较透彻,应该更多关注中低表达基因。 层次聚类的妙用: -- 全部基因——>(差异分析)——>根据趋势挑选部分特异性基因——>功能分析; -- 功能大类聚类——> ...

Sun Jul 19 19:45:00 CST 2020 0 2013
《全基因测序WGS数据分析——1.DNA测序技术》学习笔记

WGS(Whole Genome Sequencing) 指将物种细胞里面完整的基因序列全部DNA,检测并排列,此技术几乎能够鉴定出基因上任何类型的突变。 对于人类来说,全基因测序的价值是极大的,它的信息包含了所有基因和生命特征之间的内在关联性,当然也意味着更大的数据解读 ...

Tue Jun 29 19:59:00 CST 2021 0 161
 
粤ICP备18138465号  © 2018-2025 CODEPRJ.COM