原文:m6A甲基化及预测方法工具总结

DNA RNA和蛋白三个层面的可逆修饰示意图 Fu et al. Nature Reviews Genetics, DNA和蛋白存在各种修饰,RNA也不例外,目前已知的RNA修饰已经超过上百种。RNA根据编码性可分为编码RNA protein coding RNA 和非编码RNA noncoding RNA 两大类,这些RNA转录后会发生各种修饰,包括N 腺苷酸甲基化 N methyladeno ...

2019-09-14 09:18 0 1238 推荐指数:

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DNA甲基化

一、DNA甲基化简介 1 、概念:DNA甲基化是一种重要的表观遗传,是指DNA被化学小分子修饰的一种方式,即甲基(-CH3)共价结合到脱氧核糖核苷酸上,可以不改变脱氧核糖核苷酸序列而引起基因表达的的改变。 2 、发生位点:真核生物常见的甲基化位点有CpG(最主要)、CHG(H指A/T/C ...

Thu Apr 15 05:42:00 CST 2021 0 450
DNA甲基化及其测量方法(转)

转自声明的奥秘 www.lifeomics.com DNA甲基化与肿瘤发生: DNA甲基化水平和模式的改变是肿瘤发生的一个重要因素。这些变化包括CpG岛局部的高甲基化和基因组DNA低甲基化状态。如图1左所示,在正常细胞中,位于抑癌基因启动子区域的CpG岛处于 ...

Sat Nov 11 01:45:00 CST 2017 0 6634
甲基化问题锦集

甲基化问题锦集 【2017-02-18】 今天小编和大家聊聊甲基化。 问:什么是表观遗传修饰? 答:基因组表观遗传修饰主要包括DNA甲基化修饰与核小体中组蛋白的修饰等,使得被修饰DNA ...

Fri Oct 19 19:22:00 CST 2018 0 777
甲基化数据QC:使用甲基化数据计算样本间的相关性

样本间的相关性,可以反映公司加样时是否存在重复加样的错误。 下面简要介绍一下如果利用甲基化数据计算样本间的相关性 1、提取甲基化探针的snp位点、CpG的beta值 下面用的示例文件是minfi包自带的。 如果是自己的数据,那么提取甲基化snp位点用的是没有经过过滤的原始数据 ...

Wed May 27 03:27:00 CST 2020 2 572
一文读懂:DNA甲基化的作用及各种高通量检测方法比较

DNA甲基化相关定义 DNA甲基化一直以来都是表观遗传学领域研究的重点之一。DNA甲基化(Methylation)是指在DNA甲基转移酶(DNA methyltransferase, 缩写DNMT)的作用下,基因组DNA序列上CpG岛的二核苷酸5′端胞嘧啶转变为5′甲基胞嘧啶 ...

Mon Nov 11 04:58:00 CST 2019 0 1126
 
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