单细胞测序 Trajectory analysis 轨迹推断
单细胞测序 Trajectory analysis 轨迹推断细胞多样性不能通过离散的分类系统（例如细胞聚类）充分描述。观察到的细胞异质性发展的生物进程是一个连续过程（Tanay＆Regev，2017）。因此，为了捕获细胞身份之间的过渡状态、不同的分化分支或生物学功能的渐进式非同步变化，我们需要动态 ...
原文：基于单细胞测序数据构建细胞状态转换轨迹(cell trajectory)方法总结
细胞状态转换轨迹构建示意图 Trapnell et al. Nature Biotechnology, 在各种生物系统中，细胞都会展现出一系列的不同状态 如基因表达的动态变化等 ，这些状态 state 之间会按照一定的时间顺序转换。最典型的比如细胞的分化过程，从不成熟的细胞逐渐分化为成熟细胞。此外，细胞在受到外界刺激或扰动时，细胞内基因的表达也可能发生一系列的变化，从而呈现出一系列状态的转换。 ...
2019-09-08 17:36 0 1017 推荐指数：
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