实验室马上要开始做heart的单细胞空间转录组,需要提前了解一下基本的data。 废话不多说,先把示例数据和教程跑一遍,找找感觉。 参考:Seurat4.0系列教程22:空间转录组的分析、可视化与整合 样本制备 - 获取高质量数据的前提 参考 ...
单细胞测序流程 http: learn.gencore.bio.nyu.edu 在过去的十多年里,高通量测序技术被广泛应用于生物和医学的各种领域,极大促进了相关的研究和应用。其中转录组测序 RNA seq 被广泛应用于测定和描绘各类物种的基因或转录本的表达情况。但传统的转录组测序技术 bulk RNA seq 是基于群体细胞,每个样本包含成千上万个细胞,所以最终反映的是基因在群体细胞中平均表达水 ...
2019-09-07 15:23 0 1442 推荐指数:
实验室马上要开始做heart的单细胞空间转录组,需要提前了解一下基本的data。 废话不多说,先把示例数据和教程跑一遍,找找感觉。 参考:Seurat4.0系列教程22:空间转录组的分析、可视化与整合 样本制备 - 获取高质量数据的前提 参考 ...
From: https://mp.weixin.qq.com/s/4dtXwK1KTLXndGvO5m2BEQ 单细胞测序主要涉及单细胞基因组测序和转录组测序两个方面,分别针对单细胞DNA及RNA进行序列分析和比较。单细胞测序一直是科学家关注的一个热点。单细胞基因组测序目前主要有两种扩增 ...
本文总结自一篇综述: Computational approaches for interpreting scRNA-seq data 单细胞分析分为两个层次: cell level gene level Tools for the visualization ...
自从2009年单细胞转录组测序(single-cell RNA-seq,scRNA-seq)技术首次问世,至今已经有几十种不同的scRNA-seq技术相继被开发出来。在过去的十年里,单细胞转录组测序技术得到了蓬勃的发展,从而使得可在单细胞水平揭示全基因组范围内所有基因的表达情况,可以更精准的开展 ...
单细胞测序技术是指在单个细胞水平上对转录组或基因组进行扩增并测序,以检测单细胞在基因组(结构变异-Structural Variations-SVs;拷贝数变异-Copy number variants-CNVs;单核苷酸变异-Single nucleotide variants-SNVs ...
单细胞RNA测序技术之入门指南 【字体: 大 中 小 】 时间:2018年09月12日 来源:生物通 编辑推荐: 在这个飞速发展的测序时代,DNA和RNA测序已经逐渐成为“实验室中的家常菜”。若要评选出目前最受欢迎的一道菜,那恐怕非单细胞RNA测序莫属 ...
在有些情况下,细胞是很难完整分离的,比如长期保存的组织,或者大脑细胞和脂肪细胞。在分离细胞时所用的酶和破坏力往往会影响其他细胞区室的内容。此时,单核RNA测序就显得特别重要。 细胞核转录组是否代表了整个细胞的转录组,以及在snRNA-seq中发现的基因是否或多或少与特定研究相关。一些比较单细胞 ...
单细胞测序技术(single cell sequencing) 2018-03-02 11:02 来源: 一呼百诺 点击次数:6587关键词: 前言 单细胞生物学最近几年是非常热门的研究方向。在这 ...