单细胞测序数据的降维方法及细胞亚型鉴定聚类方法总结
图1、细胞亚型的鉴定及分析（Stegle et al. NATURE REVIEWS | GENETICS, 2015） 随着单细胞测序技术的发展，每个研究或实验中测定的细胞数量在显著增加。现在很多单细胞研究中，少则产生几百，多则产生几十万的细胞数量，甚至更多。其中，细胞亚型（cell ...
原文：单细胞测序数据的降维方法及细胞亚型的鉴定聚类方法总结
图 细胞亚型的鉴定及分析 Stegle et al.NATURE REVIEWS GENETICS, 随着单细胞测序技术的发展，每个研究或实验中测定的细胞数量在显著增加。现在很多单细胞研究中，少则产生几百，多则产生几十万的细胞数量，甚至更多。其中，细胞亚型 cell subtype or cell subpopulations 的鉴定是单细胞测序技术一个非常重要的基础应用。但由于单细胞测序数据通 ...
2019-09-07 14:46 0 1398 推荐指数：
相关推荐
单细胞测序数据的差异表达分析方法总结
无论是传统的多细胞转录组测序（bulk RNA-seq）还是单细胞转录组测序（scRNA-seq），差异表达分析（differential expression analysis）是比较两组不同样本基因表达异同的基本方法，可获得一组样本相对于另一组样本表达显著上调（up-regulated）和下调 ...
基于单细胞测序数据构建细胞状态转换轨迹(cell trajectory)方法总结
细胞状态转换轨迹构建示意图（Trapnell et al. Nature Biotechnology, 2014）在各种生物系统中，细胞都会展现出一系列的不同状态（如基因表达的动态变化等），这些状态（state）之间会按照一定的时间顺序转换。最典型的比如细胞的分化过程，从不成熟的细胞逐渐分化 ...
单细胞转录组测序数据的可变剪接(alternative splicing)分析方法总结
本，这些转录本分别在细胞/个体分化发育的不同阶段，在不同的组织中有各自特异的表达和功能，从而极大地丰富了编码R ...
单细胞转录组测序技术及各类数据分析方法总结
细胞间的表达异质性研究、鉴定新的细胞亚型、解析早期胚胎的发育等。 单细胞测序流程( ...
单细胞测序学习（一）
一、单细胞测序简介 单细胞测序技术（single cell sequencing）是指在单个细胞水平上，对基因组、转录组、表观组进行高通量测序分析的一项新技术，它能够弥补传统高通量测序的局限性，揭示单个细胞的基因结构和基因表达状态，反映细胞间的异质性。 我们经常看到的scRNA-seq ...
单细胞测序学习（二）
三、单细胞测序原理 今天主要介绍单细胞测序原理。10X Genomics和BD Rhapsody是目前单细胞测序的两大主流平台，所以今天的单细胞测序原理介绍也是基于这两个平台的。 （1）10X Genomics单细胞测序原理 上图是10X单细胞测序的原理图。首先要 ...
单细胞测序的知识
单细胞测序的知识 刘小泽 已关注 2018.07.20 21:33* 字数 1885 阅读 675评论 0喜欢 7 刘小泽写于18.7.20https://hemberg-lab.github.io ...