原文:查询、下载GWAS目录数据的R包(gwasrapidd)

目前GWAS方向发了很多文献,但是并没有一个很完善的R包对这些文献的数据进行汇总。 接下来推荐的这个是最新发表的GWAS数据汇总R包 。看了一下功能齐全,但是数据不是收录的很齐全 。 下面具体讲一下。 在R上安装 install.packages remotes remotes::install github ramiromagno gwasrapidd 查询是否有发表关于自身免疫性疾病的文章 l ...

2019-08-28 21:26 0 429 推荐指数:

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R下载sra数据

1)介绍 我们用SRAdb library来对SRA数据进行处理。 SRAdb 可以更方便更快的接入 metadata associated with submission, 包括study, sample, experiment, and run. SRAdb 通过 NCBI SRA数据 ...

Sat Sep 22 01:05:00 CST 2018 0 924
R下载和使用

R下载和使用: 在电脑网速正常的情况下,如果下载很慢或失败,可能是连接到了错误的镜像,可以更换镜像尝试。 # 1.通过菜单点击安装R # 1.1在R原生界面中安装# 1.2在Rstudio中安装 # 2.通过命令安装R#### install.packages('ggplot2 ...

Wed Dec 09 19:36:00 CST 2020 0 720
[R语言]foreach和doParallel实现多个数据库同时查询

R语言在进行数据查询时,每执行一条语句,都会阻塞。直到查询语句返回结果之后,才会进行下一条语句。 为了能够实现同时对多个数据库进行查询,以节省顺序执行下来的时间,首先考虑通过多线程来进行数据查询。 不过多数据库同时查询,多个结果合并起来过大的话,本地机器的内存可能是一个风险点,心里要对 ...

Tue Apr 12 01:10:00 CST 2016 0 2065
R自带数据包

datasets(R自带数据包) 作者:王彦博 作品来源:百度百科 precip #长度为70的命名向量 euro #欧元汇率,长度为11,每个元素都有命名 landmasses #48个陆地的面积,每个都有命名 rivers #北美141条河流长度 state.abb #美国50 ...

Wed May 31 04:27:00 CST 2017 7 425
R/Bioconductor下载和安装,升级

R:基本(自动加载)和推荐(安装R时也会下载,但需要手动加载),拓展(其他,手动加载)。 安装好的将被放在一个指定的目录下。这个目录被称为库(Library)。当需要使用到某一个的时候,通过运行library()函数来加载软件,其过程就是到库中去寻找需要加载的软件,并将 ...

Sun Jul 02 20:15:00 CST 2017 0 2406
keil mdk 支持下载目录

C:\Users\Administrator\AppData\Local\Arm\Packs\.Download 可以在这里把已经下载拷贝走,以便日后安装时节约时间 ...

Fri May 08 22:18:00 CST 2020 0 769
Python·下载的第三方目录

阅文时长 | 0.0分钟 字数统计 | 8.8字符 主要内容 | 1、引言&背景 2、声明与参考资料 『Python·下载的第三方目录』 编写人 ...

Wed Jun 02 08:27:00 CST 2021 0 1071
GWAS 汇总数据库大全

简介 本文汇总一些常见的GWAS summary数据链接(定期更新) 一、GWAS汇总数据库(全表型) 1.IEU OpenGWAS:包含42,484 个GWAS摘要数据集的214,725,223,303 个遗传关联的数据库 2.PheWeb: 包含Biobank Japan,以及UKB ...

Fri Jan 21 17:57:00 CST 2022 0 14065
 
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