原文:[R] 保存pheatmap图片对象到文件

一般我们使用pheatmap通过Rstudio交互得到的图片在plots的Export导出即可,如何保存对象到文件呢 这个需求在自动化流程中很常见,作者似乎也没说明。 生成示例数据: 看下数据亚子: 实现方法 接下来实现方法,分为两步: .保存对象 . 打开图形设备重新画 这个包使用的是grid图形系统而非ggplot ,所以解决方法也是不同的。通过自定义函数来生成,也可一次绘制多个对象的图形。 ...

2019-08-15 23:35 0 643 推荐指数:

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R语言——pheatmap

载入包 载入数据 绘制热图 生成行列注释 ...

Sun Mar 07 05:23:00 CST 2021 0 305
R 保存图片

R + AI + PS 是我生成文章Figure的一般流程。注意事项最多的应该在R生成原始图的步骤。 R保存原始图 保存成pdf图时,我更倾向于使用ggsave,因为它保存的图看上去更加协调。 也可以直接通过pdf()函数保存,不过默认背景是透明的,但很多杂志要求背景白色,做法 ...

Mon Sep 02 23:01:00 CST 2019 0 489
R语言 绘制热图 pheatmap

pheatmap实际上是 Pretty Heatmaps 的缩写,简单地来说,一个可以傻瓜式绘制聚类热图的R包。常用参数介绍基础设置main 图的名字file 要保存图的名字color 表示颜色,赋值渐变颜色调色板colorRampPalette属性,选择“绿,黑,红”渐变,分为100个等级,,例 ...

Tue Jun 15 01:10:00 CST 2021 0 1694
R ggplot 图片保存为 pdf

问题:使用 latex 插入图片时,pdf 和 eps 格式图片效果较好,如果是R ggplot画图,保存成 pdf 最好;如果是 Matlab 画图建议保存成 eps 图片。但是 R 语言直接使用 export 保存 pdf 图像时屡屡出现问题,要么图像显示不全,要么直接没有显示。 方法:使用 ...

Tue Jul 21 17:33:00 CST 2020 0 3087
R同时保存png/pdf等格式图片

R怎么同时保存png/pdf等多种格式的图片? 如果是ggplot对象,用ggsave用两下就行,如果不是呢? png/pdf()组合dev.off()是通常保存方法,但一个组合只能保存一个图片。要想保存多个图像,生成图片对象需要多次生成,要是一个简单的作图脚本还好,复制粘贴就行,如果是很长 ...

Sat Jun 29 06:25:00 CST 2019 0 1451
 
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